RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529273.1

ROM1-204, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene ROM1, Length 249 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-204ENST00000529273 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.91■■■■■ 4.3
ROM1-204ENST00000529273 NAIPQ13075 1403 aa41.89■■■■■ 4.3
ROM1-204ENST00000529273 ALKQ9UM73 1620 aa41.88■■■■■ 4.3
ROM1-204ENST00000529273 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
ROM1-204ENST00000529273 KCNA6P17658 529 aa41.88■■■■■ 4.29
ROM1-204ENST00000529273 HSPA1LP34931 641 aa41.88■■■■■ 4.29
ROM1-204ENST00000529273 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
ROM1-204ENST00000529273 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.85■■■■■ 4.29
ROM1-204ENST00000529273 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.83■■■■■ 4.29
ROM1-204ENST00000529273 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
ROM1-204ENST00000529273 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
ROM1-204ENST00000529273 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
ROM1-204ENST00000529273 HFM1A2PYH4 1435 aa41.76■■■■■ 4.28
ROM1-204ENST00000529273 TMEM94Q12767 1356 aa41.76■■■■■ 4.27
ROM1-204ENST00000529273 TBX22Q9Y458 520 aa41.71■■■■■ 4.27
ROM1-204ENST00000529273 TRIM52Q96A61 297 aa41.7■■■■■ 4.27
ROM1-204ENST00000529273 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
ROM1-204ENST00000529273 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.27
ROM1-204ENST00000529273 NWD1Q149M9 1564 aa41.67■■■■■ 4.26
ROM1-204ENST00000529273 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
ROM1-204ENST00000529273 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.66■■■■■ 4.26
ROM1-204ENST00000529273 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.63■■■■■ 4.26
ROM1-204ENST00000529273 ILDR2Q71H61 639 aa41.62■■■■■ 4.25
ROM1-204ENST00000529273 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
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ROM1-204ENST00000529273 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
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ROM1-204ENST00000529273 CLTCL1P53675 1640 aa41.52■■■■■ 4.24
ROM1-204ENST00000529273 PIK3R4Q99570 1358 aa41.51■■■■■ 4.24
ROM1-204ENST00000529273 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.51■■■■■ 4.24
ROM1-204ENST00000529273 MSH6P52701 1360 aa41.5■■■■■ 4.23
ROM1-204ENST00000529273 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.43■■■■■ 4.22
ROM1-204ENST00000529273 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
ROM1-204ENST00000529273 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.42■■■■■ 4.22
ROM1-204ENST00000529273 PTPRUQ92729 1446 aa41.4■■■■■ 4.22
ROM1-204ENST00000529273 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.4■■■■■ 4.22
ROM1-204ENST00000529273 C14orf37Q86TY3 774 aa41.39■■■■■ 4.22
ROM1-204ENST00000529273 SLAIN2Q9P270 581 aa41.39■■■■■ 4.22
ROM1-204ENST00000529273 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.38■■■■■ 4.21
ROM1-204ENST00000529273 FOXD1Q16676 465 aa41.37■■■■■ 4.21
ROM1-204ENST00000529273 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.36■■■■■ 4.21
ROM1-204ENST00000529273 KIF1BO60333 1816 aa41.33■■■■■ 4.21
ROM1-204ENST00000529273 METP08581 1390 aa41.32■■■■■ 4.21
ROM1-204ENST00000529273 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.31■■■■■ 4.2
ROM1-204ENST00000529273 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.31■■■■■ 4.2
ROM1-204ENST00000529273 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.3■■■■■ 4.2
ROM1-204ENST00000529273 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
ROM1-204ENST00000529273 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.27■■■■■ 4.2
ROM1-204ENST00000529273 SOCS7O14512 581 aa41.26■■■■■ 4.2
ROM1-204ENST00000529273 ATF3P18847 181 aa41.25■■■■■ 4.19
ROM1-204ENST00000529273 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.25■■■■■ 4.19
ROM1-204ENST00000529273 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
ROM1-204ENST00000529273 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
ROM1-204ENST00000529273 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.2■■■■■ 4.19
ROM1-204ENST00000529273 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
ROM1-204ENST00000529273 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.18■■■■■ 4.18
ROM1-204ENST00000529273 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
ROM1-204ENST00000529273 DCCP43146 1447 aa41.1■■■■■ 4.17
ROM1-204ENST00000529273 RGL3Q3MIN7 710 aa41.09■■■■■ 4.17
ROM1-204ENST00000529273 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.06■■■■■ 4.16
ROM1-204ENST00000529273 PPLO60437 1756 aa41.05■■■■■ 4.16
ROM1-204ENST00000529273 PHLPP1O60346 1717 aa41.05■■■■■ 4.16
ROM1-204ENST00000529273 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.05■■■■■ 4.16
ROM1-204ENST00000529273 BRINP3Q76B58 766 aa41.02■■■■■ 4.16
ROM1-204ENST00000529273 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.01■■■■■ 4.16
ROM1-204ENST00000529273 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.01■■■■■ 4.16
ROM1-204ENST00000529273 JCADQ9P266 1359 aa41■■■■■ 4.15
ROM1-204ENST00000529273 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
ROM1-204ENST00000529273 PTCH1Q13635 1447 aa40.98■■■■■ 4.15
ROM1-204ENST00000529273 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.98■■■■■ 4.15
ROM1-204ENST00000529273 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.98■■■■■ 4.15
ROM1-204ENST00000529273 MST1RQ04912 1400 aa40.97■■■■■ 4.15
ROM1-204ENST00000529273 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
ROM1-204ENST00000529273 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
ROM1-204ENST00000529273 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
ROM1-204ENST00000529273 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.92■■■■■ 4.14
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ROM1-204ENST00000529273 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.88■■■■■ 4.13
ROM1-204ENST00000529273 IFT172Q9UG01 1749 aa40.82■■■■■ 4.13
ROM1-204ENST00000529273 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.82■■■■■ 4.13
ROM1-204ENST00000529273 PIK3C2GO75747 1445 aa40.81■■■■■ 4.12
ROM1-204ENST00000529273 STK26Q9P289 416 aa40.8■■■■■ 4.12
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ROM1-204ENST00000529273 HRCP23327 699 aa40.78■■■■■ 4.12
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ROM1-204ENST00000529273 SHPRHQ149N8 1683 aa40.69■■■■■ 4.1
ROM1-204ENST00000529273 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
ROM1-204ENST00000529273 MYOM2P54296 1465 aa40.67■■■■■ 4.1
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