RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	ZFYVE9	O95405	1425 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.03	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	LRP6	O75581	1613 aa		13.02	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	ADGRL2	O95490	1459 aa		13	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	APLP2	Q06481	763 aa		13	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIM52	Q96A61	297 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	C14orf37	Q86TY3	774 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	12.97	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	ATF3	P18847	181 aa		12.96	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	BRINP3	Q76B58	766 aa		12.96	□□□□□ -0.33
MKNK1-222	ENST00000529170	PTPRU	Q92729	1446 aa		12.96	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	RXRB	P28702	533 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	PIK3R4	Q99570	1358 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	DIP2A	Q14689	1571 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	SHPRH	Q149N8	1683 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	AFF2	P51816	1311 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MKNK1-222	ENST00000529170	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170		E9PCH4	1651 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	MST1R	Q04912	1400 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	UNC13B	O14795	1591 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	TRPM2	O94759	1503 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	DCC	P43146	1447 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	MET	P08581	1390 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	NUP155	O75694	1391 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	C8orf37	Q96NL8	207 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	ROCK1	Q13464	1354 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	RGS12	O14924	1447 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MKNK1-222	ENST00000529170	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	ADAMTS2	O95450	1211 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	NGLY1	Q96IV0	654 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	ORAI2	Q96SN7	254 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	ITGAE	P38570	1179 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MKNK1-222	ENST00000529170	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	USP21	Q9UK80	565 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	ATRN	O75882	1429 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	LAMC1	P11047	1609 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	PTCH1	Q13635	1447 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	CLTCL1	P53675	1640 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
MKNK1-222	ENST00000529170	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.7	□□□□□ -0.38
MKNK1-222	ENST00000529170	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
MKNK1-222	ENST00000529170	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MKNK1-222	ENST00000529170	MYOM2	P54296	1465 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MKNK1-222	ENST00000529170	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MKNK1-222	ENST00000529170	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38

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