RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
PTPRJ-205ENST00000527952 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.02■■■■□ 3.52
PTPRJ-205ENST00000527952 ITGAEP38570 1179 aa37.01■■■■□ 3.52
PTPRJ-205ENST00000527952 UNC13BO14795 1591 aa37■■■■□ 3.51
PTPRJ-205ENST00000527952 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
PTPRJ-205ENST00000527952 ZFYVE9O95405 1425 aa36.95■■■■□ 3.51
PTPRJ-205ENST00000527952 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.95■■■■□ 3.51
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
PTPRJ-205ENST00000527952 E9PCH4 1651 aa36.94■■■■□ 3.5
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.94■■■■□ 3.5
PTPRJ-205ENST00000527952 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
PTPRJ-205ENST00000527952 NWD1Q149M9 1564 aa36.91■■■■□ 3.5
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.9■■■■□ 3.5
PTPRJ-205ENST00000527952 ROCK1Q13464 1354 aa36.9■■■■□ 3.5
PTPRJ-205ENST00000527952 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.89■■■■□ 3.5
PTPRJ-205ENST00000527952 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.87■■■■□ 3.49
PTPRJ-205ENST00000527952 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
PTPRJ-205ENST00000527952 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.85■■■■□ 3.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
PTPRJ-205ENST00000527952 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
PTPRJ-205ENST00000527952 NUP155O75694 1391 aa36.84■■■■□ 3.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MSH6P52701 1360 aa36.8■■■■□ 3.48
PTPRJ-205ENST00000527952 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
PTPRJ-205ENST00000527952 TBX22Q9Y458 520 aa36.76■■■■□ 3.48
PTPRJ-205ENST00000527952 SLAIN2Q9P270 581 aa36.74■■■■□ 3.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.73■■■■□ 3.47
PTPRJ-205ENST00000527952 C14orf37Q86TY3 774 aa36.69■■■■□ 3.46
PTPRJ-205ENST00000527952 PHLPP1O60346 1717 aa36.67■■■■□ 3.46
PTPRJ-205ENST00000527952 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.62■■■■□ 3.45
PTPRJ-205ENST00000527952 DIP2AQ14689 1571 aa36.61■■■■□ 3.45
PTPRJ-205ENST00000527952 POTEAQ6S8J7 498 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPRJ-205ENST00000527952 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPRUQ92729 1446 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
PTPRJ-205ENST00000527952 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
PTPRJ-205ENST00000527952 TRPM2O94759 1503 aa36.56■■■■□ 3.44
PTPRJ-205ENST00000527952 PIK3R4Q99570 1358 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPRJ-205ENST00000527952 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPRJ-205ENST00000527952 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.52■■■■□ 3.44
PTPRJ-205ENST00000527952 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.52■■■■□ 3.44
PTPRJ-205ENST00000527952 ATF3P18847 181 aa36.51■■■■□ 3.44
PTPRJ-205ENST00000527952 JCADQ9P266 1359 aa36.51■■■■□ 3.43
PTPRJ-205ENST00000527952 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.5■■■■□ 3.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CLTCL1P53675 1640 aa36.48■■■■□ 3.43
PTPRJ-205ENST00000527952 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
PTPRJ-205ENST00000527952 NAIPQ13075 1403 aa36.44■■■■□ 3.42
PTPRJ-205ENST00000527952 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.44■■■■□ 3.42
PTPRJ-205ENST00000527952 METP08581 1390 aa36.42■■■■□ 3.42
PTPRJ-205ENST00000527952 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM52Q96A61 297 aa36.39■■■■□ 3.42
PTPRJ-205ENST00000527952 BRINP3Q76B58 766 aa36.38■■■■□ 3.41
PTPRJ-205ENST00000527952 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.38■■■■□ 3.41
PTPRJ-205ENST00000527952 KIF1BO60333 1816 aa36.37■■■■□ 3.41
PTPRJ-205ENST00000527952 LRP6O75581 1613 aa36.37■■■■□ 3.41
PTPRJ-205ENST00000527952 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
PTPRJ-205ENST00000527952 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 SHPRHQ149N8 1683 aa36.28■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 DCCP43146 1447 aa36.27■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 MST1RQ04912 1400 aa36.27■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.26■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
PTPRJ-205ENST00000527952 HFM1A2PYH4 1435 aa36.24■■■■□ 3.39
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
PTPRJ-205ENST00000527952 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.22■■■■□ 3.39
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.21■■■■□ 3.39
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXD1Q16676 465 aa36.19■■■■□ 3.38
PTPRJ-205ENST00000527952 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.17■■■■□ 3.38
PTPRJ-205ENST00000527952 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
PTPRJ-205ENST00000527952 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.11■■■■□ 3.37
PTPRJ-205ENST00000527952 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.11■■■■□ 3.37
PTPRJ-205ENST00000527952 PPLO60437 1756 aa36.1■■■■□ 3.37
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PTPRJ-205ENST00000527952 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.07■■■■□ 3.37
PTPRJ-205ENST00000527952 PTCH1Q13635 1447 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPRJ-205ENST00000527952 AFF2P51816 1311 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPRJ-205ENST00000527952 ORAI2Q96SN7 254 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPRJ-205ENST00000527952 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.02■■■■□ 3.36
PTPRJ-205ENST00000527952 RXRBP28702 533 aa36.01■■■■□ 3.36
PTPRJ-205ENST00000527952 RGL3Q3MIN7 710 aa36.01■■■■□ 3.36
PTPRJ-205ENST00000527952 C8orf37Q96NL8 207 aa36■■■■□ 3.35
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.98■■■■□ 3.35
PTPRJ-205ENST00000527952 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.93■■■■□ 3.34
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PTPRJ-205ENST00000527952 STK26Q9P289 416 aa35.92■■■■□ 3.34
PTPRJ-205ENST00000527952 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.91■■■■□ 3.34
PTPRJ-205ENST00000527952 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.9■■■■□ 3.34
PTPRJ-205ENST00000527952 LAMC1P11047 1609 aa35.88■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.86■■■■□ 3.33
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