RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 HSCBQ8IWL3 235 aa23.42■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.41■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.41■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 TSC1Q92574 1164 aa23.41■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.41■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 SLFN5Q08AF3 891 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 PANK3Q9H999 370 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 CBX1P83916 185 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS1-205ENST00000527224 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 KIF14Q15058 1648 aa23.37■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 TERF1P54274 439 aa23.37■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 TNNQ9UQP3 1299 aa23.36■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.36■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.36■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.35■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 IGSF3O75054 1194 aa23.34■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 FBLN2P98095 1184 aa23.34■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.34■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.34■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 GBP4Q96PP9 640 aa23.34■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 ZNF521Q96K83 1311 aa23.34■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.33■■□□□ 1.33
PACS1-205ENST00000527224 DYNC1I1O14576 645 aa23.33■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 FAM177BA6PVY3 158 aa23.32■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 APAF1O14727 1248 aa23.32■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 ZBTB22O15209 634 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 PZPP20742 1482 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 SAMD9Q5K651 1589 aa23.29■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.28■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 GRIN2BQ13224 1484 aa23.28■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 E9PCH4 1651 aa23.28■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 SSFA2P28290 1259 aa23.27■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.27■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 TMEM51Q9NW97 253 aa23.27■■□□□ 1.32
PACS1-205ENST00000527224 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 RLBP1P12271 317 aa23.25■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 DDIT3P35638 169 aa23.25■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 DAPK1P53355 1430 aa23.25■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.25■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 MPNDQ8N594 471 aa23.25■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.24■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.24■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 RBSNQ9H1K0 784 aa23.24■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 ARHGEF11O15085 1522 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 PBRM1Q86U86 1689 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 PPP2R1AP30153 589 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 PDE3AQ14432 1141 aa23.22■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 ATP2B3Q16720 1220 aa23.22■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.22■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 ABCC5O15440 1437 aa23.21■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.21■■□□□ 1.31
PACS1-205ENST00000527224 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 ERCC6Q03468 1493 aa23.19■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 IQGAP2Q13576 1575 aa23.19■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 RGL3Q3MIN7 710 aa23.19■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 NEUROD2Q15784 382 aa23.18■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.18■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.17■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 INSRP06213 1382 aa23.17■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 SMC5Q8IY18 1101 aa23.16■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.16■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 ADAMTS12P58397 1594 aa23.15■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.15■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 MCTP1Q6DN14 999 aa23.15■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 ROCK1Q13464 1354 aa23.15■■□□□ 1.3
PACS1-205ENST00000527224 E9PSI1 815 aa23.15■■□□□ 1.3
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