RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 NOS1P29475 1434 aa22.25■■□□□ 1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 APLP2Q06481 763 aa22.25■■□□□ 1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 BCANQ96GW7 911 aa22.25■■□□□ 1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.23■■□□□ 1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.22■■□□□ 1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.2■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 JCADQ9P266 1359 aa22.2■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 SLAIN2Q9P270 581 aa22.18■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 ADGRL2O95490 1459 aa22.16■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.16■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.16■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 ZFYVE9O95405 1425 aa22.15■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 SHPRHQ149N8 1683 aa22.13■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.13■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.12■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 DIP2AQ14689 1571 aa22.12■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.09■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.09■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 C14orf37Q86TY3 774 aa22.09■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 UNC13BO14795 1591 aa22.08■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 TBX22Q9Y458 520 aa22.06■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 E9PCH4 1651 aa22.06■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 LRP6O75581 1613 aa22.06■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.04■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 PIK3R4Q99570 1358 aa22.03■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 TRPM2O94759 1503 aa22.03■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ATF3P18847 181 aa22.03■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.01■■□□□ 1.11
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22■■□□□ 1.11
UBASH3B-202ENST00000525711 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22■■□□□ 1.11
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM52Q96A61 297 aa21.98■■□□□ 1.11
UBASH3B-202ENST00000525711 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.95■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 DCCP43146 1447 aa21.94■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 RXRBP28702 533 aa21.93■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.91■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 BRINP3Q76B58 766 aa21.91■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.91■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.91■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.9■■□□□ 1.1
UBASH3B-202ENST00000525711 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 PTPRUQ92729 1446 aa21.89■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.88■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.87■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 ROCK1Q13464 1354 aa21.87■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 AFF2P51816 1311 aa21.85■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.84■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 MST1RQ04912 1400 aa21.84■■□□□ 1.09
UBASH3B-202ENST00000525711 NUP155O75694 1391 aa21.83■■□□□ 1.08
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF1BO60333 1816 aa21.8■■□□□ 1.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.79■■□□□ 1.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
UBASH3B-202ENST00000525711 C8orf37Q96NL8 207 aa21.78■■□□□ 1.08
UBASH3B-202ENST00000525711 RGS12O14924 1447 aa21.77■■□□□ 1.08
UBASH3B-202ENST00000525711 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.76■■□□□ 1.07
UBASH3B-202ENST00000525711 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
UBASH3B-202ENST00000525711 LAMC1P11047 1609 aa21.75■■□□□ 1.07
UBASH3B-202ENST00000525711 METP08581 1390 aa21.74■■□□□ 1.07
UBASH3B-202ENST00000525711 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
UBASH3B-202ENST00000525711 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.73■■□□□ 1.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CLTCL1P53675 1640 aa21.73■■□□□ 1.07
UBASH3B-202ENST00000525711 NGLY1Q96IV0 654 aa21.7■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ITGAEP38570 1179 aa21.69■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.68■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.68■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTS2O95450 1211 aa21.67■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PTCH1Q13635 1447 aa21.66■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 FOXD1Q16676 465 aa21.64■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 USP21Q9UK80 565 aa21.63■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PPLO60437 1756 aa21.6■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.6■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 EP400Q96L91 3159 aa21.58■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.58■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ORAI2Q96SN7 254 aa21.57■■□□□ 1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.57■■□□□ 1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 HFM1A2PYH4 1435 aa21.56■■□□□ 1.04
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