RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.59■■□□□ 1.53
HACE1-211ENST00000521962 PIP4K2BP78356 416 aa24.59■■□□□ 1.53
HACE1-211ENST00000521962 FOXD1Q16676 465 aa24.59■■□□□ 1.53
HACE1-211ENST00000521962 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.59■■□□□ 1.53
HACE1-211ENST00000521962 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.57■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.57■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 HRCP23327 699 aa24.55■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 ZFYVE9O95405 1425 aa24.54■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 LTKP29376 864 aa24.54■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.54■■□□□ 1.52
HACE1-211ENST00000521962 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HACE1-211ENST00000521962 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.49■■□□□ 1.51
HACE1-211ENST00000521962 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HACE1-211ENST00000521962 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.47■■□□□ 1.51
HACE1-211ENST00000521962 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
HACE1-211ENST00000521962 EID1Q9Y6B2 187 aa24.43■■□□□ 1.5
HACE1-211ENST00000521962 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.43■■□□□ 1.5
HACE1-211ENST00000521962 KIF1BO60333 1816 aa24.42■■□□□ 1.5
HACE1-211ENST00000521962 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.42■■□□□ 1.5
HACE1-211ENST00000521962 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.4■■□□□ 1.5
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.4■■□□□ 1.5
HACE1-211ENST00000521962 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.39■■□□□ 1.49
HACE1-211ENST00000521962 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
HACE1-211ENST00000521962 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.34■■□□□ 1.49
HACE1-211ENST00000521962 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
HACE1-211ENST00000521962 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HACE1-211ENST00000521962 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
HACE1-211ENST00000521962 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.33■■□□□ 1.49
HACE1-211ENST00000521962 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.31■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 PPLO60437 1756 aa24.31■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.29■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 IFT172Q9UG01 1749 aa24.29■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 DIP2AQ14689 1571 aa24.28■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.27■■□□□ 1.48
HACE1-211ENST00000521962 NWD1Q149M9 1564 aa24.26■■□□□ 1.47
HACE1-211ENST00000521962 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.26■■□□□ 1.47
HACE1-211ENST00000521962 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HACE1-211ENST00000521962 RGL3Q3MIN7 710 aa24.23■■□□□ 1.47
HACE1-211ENST00000521962 TMEM94Q12767 1356 aa24.22■■□□□ 1.47
HACE1-211ENST00000521962 BCANQ96GW7 911 aa24.22■■□□□ 1.47
HACE1-211ENST00000521962 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HACE1-211ENST00000521962 TBX22Q9Y458 520 aa24.2■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.2■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.18■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 MYOM2P54296 1465 aa24.18■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 PTPRUQ92729 1446 aa24.18■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 KCNA6P17658 529 aa24.17■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.17■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.17■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 METP08581 1390 aa24.16■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 PIK3C2GO75747 1445 aa24.16■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 PIK3R4Q99570 1358 aa24.15■■□□□ 1.46
HACE1-211ENST00000521962 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.12■■□□□ 1.45
HACE1-211ENST00000521962 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.07■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 POTEAQ6S8J7 498 aa24.06■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.05■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.04■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.03■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 PHLPP1O60346 1717 aa24.03■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 MSH6P52701 1360 aa24.03■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 LAMC1P11047 1609 aa24.02■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HACE1-211ENST00000521962 PTCH1Q13635 1447 aa24■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 ADGRB1O14514 1584 aa23.99■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.98■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 TECPR2O15040 1411 aa23.97■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.97■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.97■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 SLAIN2Q9P270 581 aa23.97■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.97■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 JCADQ9P266 1359 aa23.96■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 NEUROD1Q13562 356 aa23.96■■□□□ 1.43
HACE1-211ENST00000521962 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.95■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.94■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.94■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 STAC3Q96MF2 364 aa23.94■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.92■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 LRP6O75581 1613 aa23.92■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 ABCC11Q96J66 1382 aa23.91■■□□□ 1.42
HACE1-211ENST00000521962 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.89■■□□□ 1.41
HACE1-211ENST00000521962 SHPRHQ149N8 1683 aa23.89■■□□□ 1.41
HACE1-211ENST00000521962 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.87■■□□□ 1.41
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