RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521577.1

LARP1-211, Transcript of La ribonucleoprotein domain family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene LARP1, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1-211ENST00000521577 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.15■■■■□ 3.38
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LARP1-211ENST00000521577 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
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LARP1-211ENST00000521577 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.37
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LARP1-211ENST00000521577 TBX22Q9Y458 520 aa35.83■■■■□ 3.33
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LARP1-211ENST00000521577 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.7■■■■□ 3.31
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LARP1-211ENST00000521577 TONSLQ96HA7 1378 aa35.48■■■■□ 3.27
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LARP1-211ENST00000521577 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
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LARP1-211ENST00000521577 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
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LARP1-211ENST00000521577 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.36■■■■□ 3.25
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LARP1-211ENST00000521577 C14orf37Q86TY3 774 aa35.36■■■■□ 3.25
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LARP1-211ENST00000521577 TOM1O60784 492 aa35.31■■■■□ 3.24
LARP1-211ENST00000521577 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.27■■■■□ 3.24
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LARP1-211ENST00000521577 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.26■■■■□ 3.24
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LARP1-211ENST00000521577 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
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LARP1-211ENST00000521577 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.24■■■■□ 3.23
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LARP1-211ENST00000521577 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.24■■■■□ 3.23
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LARP1-211ENST00000521577 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.23■■■■□ 3.23
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LARP1-211ENST00000521577 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.21■■■■□ 3.23
LARP1-211ENST00000521577 ATF3P18847 181 aa35.2■■■■□ 3.23
LARP1-211ENST00000521577 DCCP43146 1447 aa35.19■■■■□ 3.22
LARP1-211ENST00000521577 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
LARP1-211ENST00000521577 PIP4K2BP78356 416 aa35.18■■■■□ 3.22
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