RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521263.1

C1orf198-205, Transcript of chromosome 1 open reading frame 198, human

TSL 3

Gene C1orf198, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C1orf198-205	ENST00000521263	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	43.7	■■■■■ 4.59
C1orf198-205	ENST00000521263	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.68	■■■■■ 4.58
C1orf198-205	ENST00000521263	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	43.68	■■■■■ 4.58
C1orf198-205	ENST00000521263	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		43.67	■■■■■ 4.58
C1orf198-205	ENST00000521263	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.67	■■■■■ 4.58
C1orf198-205	ENST00000521263	TRPM2	O94759	1503 aa		43.65	■■■■■ 4.58
C1orf198-205	ENST00000521263	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		43.62	■■■■■ 4.57
C1orf198-205	ENST00000521263	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		43.61	■■■■■ 4.57
C1orf198-205	ENST00000521263	TOM1	O60784	492 aa		43.6	■■■■■ 4.57
C1orf198-205	ENST00000521263	KCNA6	P17658	529 aa		43.56	■■■■■ 4.56
C1orf198-205	ENST00000521263	CLTCL1	P53675	1640 aa		43.54	■■■■■ 4.56
C1orf198-205	ENST00000521263	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		43.53	■■■■■ 4.56
C1orf198-205	ENST00000521263	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.51	■■■■■ 4.56
C1orf198-205	ENST00000521263	KIF1B	O60333	1816 aa		43.5	■■■■■ 4.55
C1orf198-205	ENST00000521263	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.49	■■■■■ 4.55
C1orf198-205	ENST00000521263	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.47	■■■■■ 4.55
C1orf198-205	ENST00000521263	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.46	■■■■■ 4.55
C1orf198-205	ENST00000521263	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.45	■■■■■ 4.55
C1orf198-205	ENST00000521263	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		43.44	■■■■■ 4.54
C1orf198-205	ENST00000521263	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.44	■■■■■ 4.54
C1orf198-205	ENST00000521263	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.42	■■■■■ 4.54
C1orf198-205	ENST00000521263	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	43.39	■■■■■ 4.54
C1orf198-205	ENST00000521263	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.39	■■■■■ 4.54
C1orf198-205	ENST00000521263	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.38	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.38	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.38	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	PIP4K2B	P78356	416 aa		43.37	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.35	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	43.35	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.33	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		43.33	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	FOXD1	Q16676	465 aa		43.32	■■■■■ 4.53
C1orf198-205	ENST00000521263	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.31	■■■■■ 4.52
C1orf198-205	ENST00000521263	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		43.31	■■■■■ 4.52
C1orf198-205	ENST00000521263	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.29	■■■■■ 4.52
C1orf198-205	ENST00000521263	ALK	Q9UM73	1620 aa		43.28	■■■■■ 4.52
C1orf198-205	ENST00000521263	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	43.25	■■■■■ 4.51
C1orf198-205	ENST00000521263	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.22	■■■■■ 4.51
C1orf198-205	ENST00000521263	HRC	P23327	699 aa		43.2	■■■■■ 4.51
C1orf198-205	ENST00000521263	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		43.2	■■■■■ 4.51
C1orf198-205	ENST00000521263	MSH6	P52701	1360 aa		43.18	■■■■■ 4.5
C1orf198-205	ENST00000521263	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		43.15	■■■■■ 4.5
C1orf198-205	ENST00000521263	HSPA1L	P34931	641 aa		43.14	■■■■■ 4.5
C1orf198-205	ENST00000521263	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.14	■■■■■ 4.5
C1orf198-205	ENST00000521263	PPL	O60437	1756 aa		43.12	■■■■■ 4.49
C1orf198-205	ENST00000521263	PTPRU	Q92729	1446 aa		43.09	■■■■■ 4.49
C1orf198-205	ENST00000521263	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		43.08	■■■■■ 4.49
C1orf198-205	ENST00000521263	C14orf37	Q86TY3	774 aa		43.07	■■■■■ 4.49
C1orf198-205	ENST00000521263	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	43.05	■■■■■ 4.48
C1orf198-205	ENST00000521263	MET	P08581	1390 aa		43.05	■■■■■ 4.48
C1orf198-205	ENST00000521263	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		43.05	■■■■■ 4.48
C1orf198-205	ENST00000521263	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		43.03	■■■■■ 4.48
C1orf198-205	ENST00000521263	RGL3	Q3MIN7	710 aa		43.03	■■■■■ 4.48
C1orf198-205	ENST00000521263	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.99	■■■■■ 4.47
C1orf198-205	ENST00000521263	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.95	■■■■■ 4.47
C1orf198-205	ENST00000521263	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.94	■■■■■ 4.47
C1orf198-205	ENST00000521263	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.94	■■■■■ 4.46
C1orf198-205	ENST00000521263	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
C1orf198-205	ENST00000521263	ATF3	P18847	181 aa		42.92	■■■■■ 4.46
C1orf198-205	ENST00000521263	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.91	■■■■■ 4.46
C1orf198-205	ENST00000521263	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
C1orf198-205	ENST00000521263	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.89	■■■■■ 4.46
C1orf198-205	ENST00000521263	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.89	■■■■■ 4.46
C1orf198-205	ENST00000521263	DCC	P43146	1447 aa		42.87	■■■■■ 4.45
C1orf198-205	ENST00000521263	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.85	■■■■■ 4.45
C1orf198-205	ENST00000521263	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.83	■■■■■ 4.45
C1orf198-205	ENST00000521263	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.79	■■■■■ 4.44
C1orf198-205	ENST00000521263	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.78	■■■■■ 4.44
C1orf198-205	ENST00000521263	MYOM2	P54296	1465 aa		42.76	■■■■■ 4.44
C1orf198-205	ENST00000521263	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.72	■■■■■ 4.43
C1orf198-205	ENST00000521263	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.7	■■■■■ 4.43
C1orf198-205	ENST00000521263	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.43
C1orf198-205	ENST00000521263	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.68	■■■■■ 4.42
C1orf198-205	ENST00000521263	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.66	■■■■■ 4.42
C1orf198-205	ENST00000521263	LAMC1	P11047	1609 aa		42.66	■■■■■ 4.42
C1orf198-205	ENST00000521263	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
C1orf198-205	ENST00000521263	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
C1orf198-205	ENST00000521263	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.65	■■■■■ 4.42
C1orf198-205	ENST00000521263	TECPR2	O15040	1411 aa		42.63	■■■■■ 4.42
C1orf198-205	ENST00000521263	MST1R	Q04912	1400 aa		42.63	■■■■■ 4.41
C1orf198-205	ENST00000521263	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.62	■■■■■ 4.41
C1orf198-205	ENST00000521263	STK26	Q9P289	416 aa		42.6	■■■■■ 4.41
C1orf198-205	ENST00000521263	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.59	■■■■■ 4.41
C1orf198-205	ENST00000521263	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.58	■■■■■ 4.41
C1orf198-205	ENST00000521263	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.58	■■■■■ 4.41
C1orf198-205	ENST00000521263	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.58	■■■■■ 4.41
C1orf198-205	ENST00000521263	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.55	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.54	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.52	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	SIRT1	Q96EB6	747 aa		42.51	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
C1orf198-205	ENST00000521263	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.5	■■■■■ 4.39
C1orf198-205	ENST00000521263	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.46	■■■■■ 4.39
C1orf198-205	ENST00000521263	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.46	■■■■■ 4.39
C1orf198-205	ENST00000521263	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.45	■■■■■ 4.39
C1orf198-205	ENST00000521263	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.4	■■■■■ 4.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms