RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
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ITGA3-215ENST00000515147 ZFYVE9O95405 1425 aa28.06■■■□□ 2.08
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ITGA3-215ENST00000515147 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.04■■■□□ 2.08
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ITGA3-215ENST00000515147 HFM1A2PYH4 1435 aa27.24■■□□□ 1.95
ITGA3-215ENST00000515147 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
ITGA3-215ENST00000515147 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
ITGA3-215ENST00000515147 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.18■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 ATRNO75882 1429 aa27.18■■□□□ 1.94
ITGA3-215ENST00000515147 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
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