RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TMEM94Q12767 1356 aa25.95■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 ZFYVE9O95405 1425 aa25.92■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.91■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 E9PCH4 1651 aa25.9■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.9■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.9■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.89■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 NUP155O75694 1391 aa25.89■■□□□ 1.74
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.88■■□□□ 1.73
HERC3-211ENST00000513325 NWD1Q149M9 1564 aa25.86■■□□□ 1.73
HERC3-211ENST00000513325 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HERC3-211ENST00000513325 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
HERC3-211ENST00000513325 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.84■■□□□ 1.73
HERC3-211ENST00000513325 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
HERC3-211ENST00000513325 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
HERC3-211ENST00000513325 TBX22Q9Y458 520 aa25.81■■□□□ 1.72
HERC3-211ENST00000513325 MSH6P52701 1360 aa25.78■■□□□ 1.72
HERC3-211ENST00000513325 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.76■■□□□ 1.71
HERC3-211ENST00000513325 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.74■■□□□ 1.71
HERC3-211ENST00000513325 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HERC3-211ENST00000513325 SLAIN2Q9P270 581 aa25.72■■□□□ 1.71
HERC3-211ENST00000513325 DIP2AQ14689 1571 aa25.69■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 C14orf37Q86TY3 774 aa25.68■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.68■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 PIK3R4Q99570 1358 aa25.68■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.66■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 NAIPQ13075 1403 aa25.65■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.64■■□□□ 1.7
HERC3-211ENST00000513325 TRPM2O94759 1503 aa25.63■■□□□ 1.69
HERC3-211ENST00000513325 PTPRUQ92729 1446 aa25.63■■□□□ 1.69
HERC3-211ENST00000513325 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.61■■□□□ 1.69
HERC3-211ENST00000513325 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.59■■□□□ 1.69
HERC3-211ENST00000513325 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.59■■□□□ 1.69
HERC3-211ENST00000513325 PHLPP1O60346 1717 aa25.58■■□□□ 1.69
HERC3-211ENST00000513325 ATF3P18847 181 aa25.58■■□□□ 1.69
HERC3-211ENST00000513325 CLTCL1P53675 1640 aa25.58■■□□□ 1.69
HERC3-211ENST00000513325 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.57■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 TRIM52Q96A61 297 aa25.57■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 JCADQ9P266 1359 aa25.55■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 METP08581 1390 aa25.54■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 HFM1A2PYH4 1435 aa25.54■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.53■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
HERC3-211ENST00000513325 POTEAQ6S8J7 498 aa25.51■■□□□ 1.67
HERC3-211ENST00000513325 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HERC3-211ENST00000513325 KIF1BO60333 1816 aa25.49■■□□□ 1.67
HERC3-211ENST00000513325 BRINP3Q76B58 766 aa25.46■■□□□ 1.67
HERC3-211ENST00000513325 DCCP43146 1447 aa25.46■■□□□ 1.67
HERC3-211ENST00000513325 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
HERC3-211ENST00000513325 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.41■■□□□ 1.66
HERC3-211ENST00000513325 MST1RQ04912 1400 aa25.41■■□□□ 1.66
HERC3-211ENST00000513325 LRP6O75581 1613 aa25.4■■□□□ 1.66
HERC3-211ENST00000513325 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.39■■□□□ 1.66
HERC3-211ENST00000513325 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.39■■□□□ 1.66
HERC3-211ENST00000513325 FOXD1Q16676 465 aa25.39■■□□□ 1.66
HERC3-211ENST00000513325 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.37■■□□□ 1.65
HERC3-211ENST00000513325 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HERC3-211ENST00000513325 SHPRHQ149N8 1683 aa25.36■■□□□ 1.65
HERC3-211ENST00000513325 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.34■■□□□ 1.65
HERC3-211ENST00000513325 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HERC3-211ENST00000513325 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.32■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 PTCH1Q13635 1447 aa25.31■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 PPLO60437 1756 aa25.31■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.3■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.3■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.29■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.28■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 RGL3Q3MIN7 710 aa25.27■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.27■■□□□ 1.64
HERC3-211ENST00000513325 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.26■■□□□ 1.63
HERC3-211ENST00000513325 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.25■■□□□ 1.63
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.23■■□□□ 1.63
HERC3-211ENST00000513325 ORAI2Q96SN7 254 aa25.22■■□□□ 1.63
HERC3-211ENST00000513325 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.2■■□□□ 1.63
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.18■■□□□ 1.62
HERC3-211ENST00000513325 AFF2P51816 1311 aa25.17■■□□□ 1.62
HERC3-211ENST00000513325 STK26Q9P289 416 aa25.17■■□□□ 1.62
HERC3-211ENST00000513325 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HERC3-211ENST00000513325 RXRBP28702 533 aa25.15■■□□□ 1.62
HERC3-211ENST00000513325 LAMC1P11047 1609 aa25.15■■□□□ 1.62
HERC3-211ENST00000513325 IFT172Q9UG01 1749 aa25.15■■□□□ 1.62
HERC3-211ENST00000513325 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.14■■□□□ 1.62
HERC3-211ENST00000513325 C8orf37Q96NL8 207 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms