RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 LTKP29376 864 aa29.29■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.28■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 IDI1Q13907 227 aa29.28■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.28■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 EID1Q9Y6B2 187 aa29.27■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.27■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 CLTCL1P53675 1640 aa29.27■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.25■■■□□ 2.27
SMIM20-201ENST00000506197 KIF1BO60333 1816 aa29.25■■■□□ 2.27
SMIM20-201ENST00000506197 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.23■■■□□ 2.27
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SMIM20-201ENST00000506197 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.19■■■□□ 2.26
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SMIM20-201ENST00000506197 ZFYVE9O95405 1425 aa29.08■■■□□ 2.25
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SMIM20-201ENST00000506197 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.03■■■□□ 2.24
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SMIM20-201ENST00000506197 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.57■■■□□ 2.16
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SMIM20-201ENST00000506197 ATF3P18847 181 aa28.55■■■□□ 2.16
SMIM20-201ENST00000506197 DCCP43146 1447 aa28.53■■■□□ 2.16
SMIM20-201ENST00000506197 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SMIM20-201ENST00000506197 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
SMIM20-201ENST00000506197 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.49■■■□□ 2.15
SMIM20-201ENST00000506197 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.49■■■□□ 2.15
SMIM20-201ENST00000506197 ADGRB1O14514 1584 aa28.49■■■□□ 2.15
SMIM20-201ENST00000506197 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
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