RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
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SH3BP2-208ENST00000504294 CLTCL1P53675 1640 aa21.23■□□□□ 0.99
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZFYVE9O95405 1425 aa21.22■□□□□ 0.99
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SH3BP2-208ENST00000504294 NWD1Q149M9 1564 aa20.93■□□□□ 0.94
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SH3BP2-208ENST00000504294 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-208ENST00000504294 PTCH1Q13635 1447 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPRUQ92729 1446 aa20.85■□□□□ 0.93
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SH3BP2-208ENST00000504294 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-208ENST00000504294 TECPR2O15040 1411 aa20.8■□□□□ 0.92
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SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.76■□□□□ 0.91
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SH3BP2-208ENST00000504294 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRB1O14514 1584 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-208ENST00000504294 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP2-208ENST00000504294 PIP4K2BP78356 416 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP2-208ENST00000504294 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP2-208ENST00000504294 PRAM1Q96QH2 718 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP2-208ENST00000504294 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP2-208ENST00000504294 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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