RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRK-215ENST00000498284 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
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PTPRK-215ENST00000498284 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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PTPRK-215ENST00000498284 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRK-215ENST00000498284 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-215ENST00000498284 NR1I2O75469 434 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-215ENST00000498284 COPS2P61201 443 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-215ENST00000498284 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-215ENST00000498284 LILRB3O75022 631 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-215ENST00000498284 QPCTQ16769 361 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-215ENST00000498284 Q3C1V9 767 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-215ENST00000498284 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
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