RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		40.94	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	IFT172	Q9UG01	1749 aa		40.94	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		40.91	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	PPL	O60437	1756 aa		40.9	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	STAC3	Q96MF2	364 aa		40.89	■■■■■ 4.14
TTC19-208	ENST00000497842	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.13
TTC19-208	ENST00000497842	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		40.86	■■■■■ 4.13
TTC19-208	ENST00000497842	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		40.83	■■■■■ 4.13
TTC19-208	ENST00000497842	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.82	■■■■■ 4.13
TTC19-208	ENST00000497842	MYOM2	P54296	1465 aa		40.81	■■■■■ 4.12
TTC19-208	ENST00000497842	SOCS7	O14512	581 aa		40.77	■■■■■ 4.12
TTC19-208	ENST00000497842	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
TTC19-208	ENST00000497842	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		40.74	■■■■■ 4.11
TTC19-208	ENST00000497842	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
TTC19-208	ENST00000497842	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		40.73	■■■■■ 4.11
TTC19-208	ENST00000497842	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.73	■■■■■ 4.11
TTC19-208	ENST00000497842	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TTC19-208	ENST00000497842	ZFYVE9	O95405	1425 aa		40.71	■■■■■ 4.11
TTC19-208	ENST00000497842	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	40.71	■■■■■ 4.11
TTC19-208	ENST00000497842	SLIT1	O75093	1534 aa		40.69	■■■■■ 4.1
TTC19-208	ENST00000497842	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		40.68	■■■■■ 4.1
TTC19-208	ENST00000497842	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		40.67	■■■■■ 4.1
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.65	■■■■■ 4.1
TTC19-208	ENST00000497842	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		40.65	■■■■■ 4.1
TTC19-208	ENST00000497842	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.1
TTC19-208	ENST00000497842	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		40.63	■■■■■ 4.09
TTC19-208	ENST00000497842	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.61	■■■■■ 4.09
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		40.61	■■■■■ 4.09
TTC19-208	ENST00000497842	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.6	■■■■■ 4.09
TTC19-208	ENST00000497842	PIK3C2G	O75747	1445 aa		40.59	■■■■■ 4.09
TTC19-208	ENST00000497842	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		40.58	■■■■■ 4.09
TTC19-208	ENST00000497842	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
TTC19-208	ENST00000497842	LAMC1	P11047	1609 aa		40.54	■■■■■ 4.08
TTC19-208	ENST00000497842	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.52	■■■■■ 4.08
TTC19-208	ENST00000497842	LTK	P29376	864 aa		40.5	■■■■■ 4.07
TTC19-208	ENST00000497842	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.48	■■■■■ 4.07
TTC19-208	ENST00000497842	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
TTC19-208	ENST00000497842	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
TTC19-208	ENST00000497842	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		40.46	■■■■■ 4.07
TTC19-208	ENST00000497842	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		40.46	■■■■■ 4.07
TTC19-208	ENST00000497842	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
TTC19-208	ENST00000497842	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.45	■■■■■ 4.07
TTC19-208	ENST00000497842	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		40.44	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.43	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	BCAN	Q96GW7	911 aa		40.41	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		40.4	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		40.39	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		40.38	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.06
TTC19-208	ENST00000497842	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
TTC19-208	ENST00000497842	DIP2A	Q14689	1571 aa		40.31	■■■■■ 4.04
TTC19-208	ENST00000497842	ADGRB1	O14514	1584 aa		40.3	■■■■■ 4.04
TTC19-208	ENST00000497842	MED14	O60244	1454 aa		40.29	■■■■■ 4.04
TTC19-208	ENST00000497842	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		40.28	■■■■■ 4.04
TTC19-208	ENST00000497842	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
TTC19-208	ENST00000497842	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	40.26	■■■■■ 4.04
TTC19-208	ENST00000497842	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		40.24	■■■■■ 4.03
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		40.24	■■■■■ 4.03
TTC19-208	ENST00000497842	USP47	Q96K76	1375 aa		40.24	■■■■■ 4.03
TTC19-208	ENST00000497842	TBX22	Q9Y458	520 aa		40.23	■■■■■ 4.03
TTC19-208	ENST00000497842	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		40.21	■■■■■ 4.03
TTC19-208	ENST00000497842	MET	P08581	1390 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TTC19-208	ENST00000497842	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
TTC19-208	ENST00000497842	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
TTC19-208	ENST00000497842	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
TTC19-208	ENST00000497842	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
TTC19-208	ENST00000497842	PIK3R4	Q99570	1358 aa		40.1	■■■■■ 4.01
TTC19-208	ENST00000497842	STK26	Q9P289	416 aa		40.1	■■■■■ 4.01
TTC19-208	ENST00000497842	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		40.1	■■■■■ 4.01
TTC19-208	ENST00000497842	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		40.09	■■■■■ 4.01
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
TTC19-208	ENST00000497842	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
TTC19-208	ENST00000497842	CPS1	P31327	1500 aa		40.07	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	HSPA1L	P34931	641 aa		40.06	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.06	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	ABCC11	Q96J66	1382 aa		40.05	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	DLC1	Q96QB1	1528 aa		40.04	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		40.04	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	TOM1	O60784	492 aa		40.02	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
TTC19-208	ENST00000497842	TECPR2	O15040	1411 aa		40.01	■■■■□ 3.99
TTC19-208	ENST00000497842	PTPRU	Q92729	1446 aa		39.99	■■■■□ 3.99
TTC19-208	ENST00000497842	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	39.98	■■■■□ 3.99
TTC19-208	ENST00000497842	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		39.97	■■■■□ 3.99
TTC19-208	ENST00000497842	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
TTC19-208	ENST00000497842	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	39.96	■■■■□ 3.99
TTC19-208	ENST00000497842	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		39.96	■■■■□ 3.99
TTC19-208	ENST00000497842	SIRT1	Q96EB6	747 aa		39.94	■■■■□ 3.98
TTC19-208	ENST00000497842	POGK	Q9P215	609 aa		39.93	■■■■□ 3.98
TTC19-208	ENST00000497842	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		39.92	■■■■□ 3.98

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