RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496038.1

BCAN-208, Transcript of brevican, humanhuman

TSL 2

Gene BCAN, Length 1,871 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAN-208ENST00000496038 NLRP13Q86W25 1043 aa20.82■□□□□ 0.92
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BCAN-208ENST00000496038 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
BCAN-208ENST00000496038 ZNF521Q96K83 1311 aa20.44■□□□□ 0.86
BCAN-208ENST00000496038 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.44■□□□□ 0.86
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BCAN-208ENST00000496038 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.43■□□□□ 0.86
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BCAN-208ENST00000496038 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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BCAN-208ENST00000496038 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.38■□□□□ 0.85
BCAN-208ENST00000496038 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.37■□□□□ 0.85
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BCAN-208ENST00000496038 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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BCAN-208ENST00000496038 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.36■□□□□ 0.85
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BCAN-208ENST00000496038 SHPRHQ149N8 1683 aa20.35■□□□□ 0.85
BCAN-208ENST00000496038 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
BCAN-208ENST00000496038 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.35■□□□□ 0.85
BCAN-208ENST00000496038 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.34■□□□□ 0.85
BCAN-208ENST00000496038 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.33■□□□□ 0.85
BCAN-208ENST00000496038 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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BCAN-208ENST00000496038 NGEFQ8N5V2 710 aa20.31■□□□□ 0.84
BCAN-208ENST00000496038 IDI1Q13907 227 aa20.3■□□□□ 0.84
BCAN-208ENST00000496038 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.3■□□□□ 0.84
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