RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 MSH6P52701 1360 aa32.51■■■□□ 2.79
NELFE-210ENST00000491139 NWD1Q149M9 1564 aa32.49■■■□□ 2.79
NELFE-210ENST00000491139 SLAIN2Q9P270 581 aa32.47■■■□□ 2.79
NELFE-210ENST00000491139 HDGFP51858 240 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
NELFE-210ENST00000491139 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
NELFE-210ENST00000491139 ADGRL2O95490 1459 aa32.42■■■□□ 2.78
NELFE-210ENST00000491139 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
NELFE-210ENST00000491139 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa32.42■■■□□ 2.78
NELFE-210ENST00000491139 ZFYVE9O95405 1425 aa32.4■■■□□ 2.78
NELFE-210ENST00000491139 JCADQ9P266 1359 aa32.39■■■□□ 2.78
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.39■■■□□ 2.78
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NELFE-210ENST00000491139 TBX22Q9Y458 520 aa32.34■■■□□ 2.77
NELFE-210ENST00000491139 MYO5BQ9ULV0 1848 aa32.34■■■□□ 2.77
NELFE-210ENST00000491139 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.31■■■□□ 2.76
NELFE-210ENST00000491139 C14orf37Q86TY3 774 aa32.31■■■□□ 2.76
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NELFE-210ENST00000491139 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.31■■■□□ 2.76
NELFE-210ENST00000491139 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa32.3■■■□□ 2.76
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NELFE-210ENST00000491139 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.24■■■□□ 2.75
NELFE-210ENST00000491139 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa32.24■■■□□ 2.75
NELFE-210ENST00000491139 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
NELFE-210ENST00000491139 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.22■■■□□ 2.75
NELFE-210ENST00000491139 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.21■■■□□ 2.75
NELFE-210ENST00000491139 ATF3P18847 181 aa32.21■■■□□ 2.75
NELFE-210ENST00000491139 PIK3R4Q99570 1358 aa32.2■■■□□ 2.75
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NELFE-210ENST00000491139 UNC13BO14795 1591 aa32.18■■■□□ 2.74
NELFE-210ENST00000491139 DIP2AQ14689 1571 aa32.17■■■□□ 2.74
NELFE-210ENST00000491139 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
NELFE-210ENST00000491139 LRP6O75581 1613 aa32.16■■■□□ 2.74
NELFE-210ENST00000491139 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
NELFE-210ENST00000491139 E9PCH4 1651 aa32.15■■■□□ 2.74
NELFE-210ENST00000491139 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
NELFE-210ENST00000491139 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.12■■■□□ 2.73
NELFE-210ENST00000491139 TRPM2O94759 1503 aa32.09■■■□□ 2.73
NELFE-210ENST00000491139 SHPRHQ149N8 1683 aa32.08■■■□□ 2.73
NELFE-210ENST00000491139 TRIM52Q96A61 297 aa32.08■■■□□ 2.73
NELFE-210ENST00000491139 ROCK1Q13464 1354 aa32.07■■■□□ 2.73
NELFE-210ENST00000491139 BRINP3Q76B58 766 aa32.07■■■□□ 2.72
NELFE-210ENST00000491139 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32.06■■■□□ 2.72
NELFE-210ENST00000491139 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP32.05■■■□□ 2.72
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NELFE-210ENST00000491139 NUP155O75694 1391 aa32.05■■■□□ 2.72
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NELFE-210ENST00000491139 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
NELFE-210ENST00000491139 RXRBP28702 533 aa32.02■■■□□ 2.72
NELFE-210ENST00000491139 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
NELFE-210ENST00000491139 DCCP43146 1447 aa32.01■■■□□ 2.72
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NELFE-210ENST00000491139 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.93■■■□□ 2.7
NELFE-210ENST00000491139 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
NELFE-210ENST00000491139 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
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NELFE-210ENST00000491139 AFF2P51816 1311 aa31.92■■■□□ 2.7
NELFE-210ENST00000491139 MST1RQ04912 1400 aa31.92■■■□□ 2.7
NELFE-210ENST00000491139 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.91■■■□□ 2.7
NELFE-210ENST00000491139 ITGAEP38570 1179 aa31.91■■■□□ 2.7
NELFE-210ENST00000491139 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
NELFE-210ENST00000491139 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
NELFE-210ENST00000491139 METP08581 1390 aa31.88■■■□□ 2.69
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NELFE-210ENST00000491139 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.85■■■□□ 2.69
NELFE-210ENST00000491139 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.83■■■□□ 2.69
NELFE-210ENST00000491139 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
NELFE-210ENST00000491139 C8orf37Q96NL8 207 aa31.81■■■□□ 2.68
NELFE-210ENST00000491139 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
NELFE-210ENST00000491139 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.79■■■□□ 2.68
NELFE-210ENST00000491139 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
NELFE-210ENST00000491139 NALCNQ8IZF0 1738 aa31.73■■■□□ 2.67
NELFE-210ENST00000491139 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.73■■■□□ 2.67
NELFE-210ENST00000491139 NGLY1Q96IV0 654 aa31.72■■■□□ 2.67
NELFE-210ENST00000491139 RGS12O14924 1447 aa31.72■■■□□ 2.67
NELFE-210ENST00000491139 C1orf167Q5SNV9 1468 aa31.71■■■□□ 2.67
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTS2O95450 1211 aa31.7■■■□□ 2.67
NELFE-210ENST00000491139 CLTCL1P53675 1640 aa31.7■■■□□ 2.66
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NELFE-210ENST00000491139 KIF1BO60333 1816 aa31.65■■■□□ 2.66
NELFE-210ENST00000491139 ORAI2Q96SN7 254 aa31.64■■■□□ 2.66
NELFE-210ENST00000491139 PTCH1Q13635 1447 aa31.64■■■□□ 2.66
NELFE-210ENST00000491139 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
NELFE-210ENST00000491139 LAMC1P11047 1609 aa31.61■■■□□ 2.65
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NELFE-210ENST00000491139 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
NELFE-210ENST00000491139 ATAD2Q6PL18 1390 aa31.56■■■□□ 2.64
NELFE-210ENST00000491139 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.54■■■□□ 2.64
NELFE-210ENST00000491139 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
NELFE-210ENST00000491139 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.53■■■□□ 2.64
NELFE-210ENST00000491139 HFM1A2PYH4 1435 aa31.52■■■□□ 2.64
NELFE-210ENST00000491139 NAIPQ13075 1403 aa31.51■■■□□ 2.64
NELFE-210ENST00000491139 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa31.5■■■□□ 2.63
NELFE-210ENST00000491139 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.48■■■□□ 2.63
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