RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 SLFN5Q08AF3 891 aa13.3□□□□□ -0.28
VWA3B-217ENST00000489630 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.3□□□□□ -0.28
VWA3B-217ENST00000489630 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.3□□□□□ -0.28
VWA3B-217ENST00000489630 BCAR3O75815 825 aa13.29□□□□□ -0.28
VWA3B-217ENST00000489630 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
VWA3B-217ENST00000489630 SYNJ2O15056 1496 aa13.29□□□□□ -0.28
VWA3B-217ENST00000489630 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
VWA3B-217ENST00000489630 IGHDP01880 384 aa13.27□□□□□ -0.28
VWA3B-217ENST00000489630 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.27□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 UNC13BO14795 1591 aa13.27□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 APAF1O14727 1248 aa13.27□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 USP19O94966 1318 aa13.26□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.26□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 NUP160Q12769 1436 aa13.26□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 SEC24BO95487 1268 aa13.25□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.25□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 PREX2Q70Z35 1606 aa13.24□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 ARXQ96QS3 562 aa13.24□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.23□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 POGKQ9P215 609 aa13.23□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.23□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.22□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.22□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 PIK3C2GO75747 1445 aa13.22□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 PANK1Q8TE04 598 aa13.21□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.21□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 COG6Q9Y2V7 657 aa13.2□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 E9PSI1 815 aa13.2□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 SYNMO15061 1565 aa13.2□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.19□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 ATP10AO60312 1499 aa13.19□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 MADDQ8WXG6 1647 aa13.19□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 IQGAP1P46940 1657 aa13.18□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.18□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.18□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 CANXP27824 592 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 KLHL34Q8N239 644 aa13.18□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.18□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 ABCC2Q92887 1545 aa13.18□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 CDCA8Q53HL2 280 aa13.18□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.17□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 MYOM1P52179 1685 aa13.16□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 NLRP1Q9C000 1473 aa13.16□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.16□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 BECN1Q14457 450 aa13.16□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 PLXNC1O60486 1568 aa13.16□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 PDE3AQ14432 1141 aa13.15□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.15□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 TNNQ9UQP3 1299 aa13.15□□□□□ -0.3
VWA3B-217ENST00000489630 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.14□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 WWC1Q8IX03 1113 aa13.14□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.14□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.14□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 NEUROD2Q15784 382 aa13.13□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.12□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa13.12□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 RLBP1P12271 317 aa13.12□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.12□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.12□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.11□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.1□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.1□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa13.1□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.09□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 RARSP54136 660 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.09□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
VWA3B-217ENST00000489630 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.08□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.08□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 ERVK-7P63135 1459 aa13.08□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 TRPM2O94759 1503 aa13.07□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 CLTCL1P53675 1640 aa13.07□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 CEP152O94986 1710 aa13.07□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.06□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 NGEFQ8N5V2 710 aa13.06□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.05□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 PANK2Q9BZ23 570 aa13.05□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.04□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 PTPRTO14522 1441 aa13.03□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 MCM4P33991 863 aa13.03□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 RUNDC1Q96C34 613 aa13.03□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.03□□□□□ -0.32
VWA3B-217ENST00000489630 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms