RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.45■■■□□ 2.3
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRPM2O94759 1503 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 TOM1O60784 492 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KIF1BO60333 1816 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.24■■■□□ 2.27
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 ABCC11Q96J66 1382 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-212ENST00000487849 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SIRT1Q96EB6 747 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PHLPP1O60346 1717 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NEUROD1Q13562 356 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-212ENST00000487849 POGKQ9P215 609 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.55■■■□□ 2.16
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.53■■■□□ 2.16
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