RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 POTEAQ6S8J7 498 aa18.28■□□□□ 0.52
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RABGEF1-207ENST00000484547 PPLO60437 1756 aa17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 USP21Q9UK80 565 aa17.74■□□□□ 0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 HFM1A2PYH4 1435 aa17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1-207ENST00000484547 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.72■□□□□ 0.43
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