RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 RIMS2Q9UQ26 1411 aa48.43■■■■■ 5.34
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa48.41■■■■■ 5.34
CHKB-210ENST00000484266 PCGF6Q9BYE7 350 aa48.34■■■■■ 5.33
CHKB-210ENST00000484266 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
CHKB-210ENST00000484266 HDGFP51858 240 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
CHKB-210ENST00000484266 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa48.29■■■■■ 5.32
CHKB-210ENST00000484266 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa48.29■■■■■ 5.32
CHKB-210ENST00000484266 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP48.29■■■■■ 5.32
CHKB-210ENST00000484266 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP48.25■■■■■ 5.32
CHKB-210ENST00000484266 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP48.24■■■■■ 5.31
CHKB-210ENST00000484266 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa48.22■■■■■ 5.31
CHKB-210ENST00000484266 PPLO60437 1756 aa48.2■■■■■ 5.31
CHKB-210ENST00000484266 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa48.15■■■■■ 5.3
CHKB-210ENST00000484266 RGL3Q3MIN7 710 aa48.14■■■■■ 5.3
CHKB-210ENST00000484266 IFT172Q9UG01 1749 aa48.12■■■■■ 5.29
CHKB-210ENST00000484266 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP48.12■■■■■ 5.29
CHKB-210ENST00000484266 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
CHKB-210ENST00000484266 LTBP4Q8N2S1 1624 aa48.1■■■■■ 5.29
CHKB-210ENST00000484266 BCANQ96GW7 911 aa48.08■■■■■ 5.29
CHKB-210ENST00000484266 SLC26A8Q96RN1 970 aa48.07■■■■■ 5.28
CHKB-210ENST00000484266 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa48.06■■■■■ 5.28
CHKB-210ENST00000484266 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa48.05■■■■■ 5.28
CHKB-210ENST00000484266 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa48.04■■■■■ 5.28
CHKB-210ENST00000484266 VGFO15240 615 aaPredicted RBP48.02■■■■■ 5.28
CHKB-210ENST00000484266 DIP2AQ14689 1571 aa48.01■■■■■ 5.28
CHKB-210ENST00000484266 STRCP1A6NGW2 1772 aa48■■■■■ 5.27
CHKB-210ENST00000484266 TBX22Q9Y458 520 aa47.95■■■■■ 5.27
CHKB-210ENST00000484266 CPS1P31327 1500 aa47.9■■■■■ 5.26
CHKB-210ENST00000484266 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa47.9■■■■■ 5.26
CHKB-210ENST00000484266 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.25
CHKB-210ENST00000484266 MYOM2P54296 1465 aa47.87■■■■■ 5.25
CHKB-210ENST00000484266 SIN3AQ96ST3 1273 aa47.86■■■■■ 5.25
CHKB-210ENST00000484266 NWD1Q149M9 1564 aa47.86■■■■■ 5.25
CHKB-210ENST00000484266 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
CHKB-210ENST00000484266 CERKQ8TCT0 537 aa47.84■■■■■ 5.25
CHKB-210ENST00000484266 ALKQ9UM73 1620 aa47.82■■■■■ 5.25
CHKB-210ENST00000484266 NRXN1Q9ULB1 1477 aa47.81■■■■■ 5.24
CHKB-210ENST00000484266 KCNA6P17658 529 aa47.81■■■■■ 5.24
CHKB-210ENST00000484266 PIK3R4Q99570 1358 aa47.81■■■■■ 5.24
CHKB-210ENST00000484266 PIK3C2GO75747 1445 aa47.8■■■■■ 5.24
CHKB-210ENST00000484266 DCAF11Q8TEB1 546 aa47.76■■■■■ 5.24
CHKB-210ENST00000484266 METP08581 1390 aa47.76■■■■■ 5.24
CHKB-210ENST00000484266 NEUROD1Q13562 356 aa47.73■■■■■ 5.23
CHKB-210ENST00000484266 PTPRUQ92729 1446 aa47.73■■■■■ 5.23
CHKB-210ENST00000484266 LRRC7Q96NW7 1537 aa47.73■■■■■ 5.23
CHKB-210ENST00000484266 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
CHKB-210ENST00000484266 IQSEC2Q5JU85 1478 aa47.7■■■■■ 5.23
CHKB-210ENST00000484266 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa47.7■■■■■ 5.23
CHKB-210ENST00000484266 STAC3Q96MF2 364 aa47.69■■■■■ 5.22
CHKB-210ENST00000484266 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP47.68■■■■■ 5.22
CHKB-210ENST00000484266 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
CHKB-210ENST00000484266 LAMC1P11047 1609 aa47.64■■■■■ 5.22
CHKB-210ENST00000484266 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa47.63■■■■■ 5.21
CHKB-210ENST00000484266 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa47.6■■■■■ 5.21
CHKB-210ENST00000484266 L3MBTL2Q969R5 705 aa47.59■■■■■ 5.21
CHKB-210ENST00000484266 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
CHKB-210ENST00000484266 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP47.56■■■■■ 5.2
CHKB-210ENST00000484266 CFAP70Q5T0N1 1121 aa47.55■■■■■ 5.2
CHKB-210ENST00000484266 TMEM94Q12767 1356 aa47.54■■■■■ 5.2
CHKB-210ENST00000484266 CLSPNQ9HAW4 1339 aa47.5■■■■■ 5.19
CHKB-210ENST00000484266 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
CHKB-210ENST00000484266 PRAG1Q86YV5 1406 aa47.48■■■■■ 5.19
CHKB-210ENST00000484266 TMEM132EQ6IEE7 984 aa47.47■■■■■ 5.19
CHKB-210ENST00000484266 PTCH1Q13635 1447 aa47.43■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 TONSLQ96HA7 1378 aa47.43■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 ADGRB1O14514 1584 aa47.43■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 KNDC1Q76NI1 1749 aa47.42■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa47.42■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa47.39■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 TECPR2O15040 1411 aa47.38■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 ROBO2Q9HCK4 1378 aa47.38■■■■■ 5.18
CHKB-210ENST00000484266 FBXO41Q8TF61 875 aa47.36■■■■■ 5.17
CHKB-210ENST00000484266 ABCC11Q96J66 1382 aa47.36■■■■■ 5.17
CHKB-210ENST00000484266 STK26Q9P289 416 aa47.35■■■■■ 5.17
CHKB-210ENST00000484266 UBAP1LF5GYI3 381 aa47.3■■■■■ 5.16
CHKB-210ENST00000484266 MSH6P52701 1360 aa47.28■■■■■ 5.16
CHKB-210ENST00000484266 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa47.26■■■■■ 5.16
CHKB-210ENST00000484266 NALCNQ8IZF0 1738 aa47.25■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 C14orf37Q86TY3 774 aa47.25■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 TOM1O60784 492 aa47.23■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 DLC1Q96QB1 1528 aa47.21■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa47.21■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 NBPF1Q3BBV0 1214 aa47.21■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 C19orf44Q9H6X5 657 aa47.2■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 FAM135BQ49AJ0 1406 aa47.19■■■■■ 5.15
CHKB-210ENST00000484266 NBPF8Q3BBV2 869 aa47.19■■■■■ 5.14
CHKB-210ENST00000484266 SIRT1Q96EB6 747 aa47.17■■■■■ 5.14
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa47.17■■■■■ 5.14
CHKB-210ENST00000484266 WAPLQ7Z5K2 1190 aa47.16■■■■■ 5.14
CHKB-210ENST00000484266 TRAK1Q9UPV9 953 aa47.13■■■■■ 5.14
CHKB-210ENST00000484266 DCCP43146 1447 aa47.13■■■■■ 5.14
CHKB-210ENST00000484266 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.13
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
CHKB-210ENST00000484266 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa47.11■■■■■ 5.13
CHKB-210ENST00000484266 PRAM1Q96QH2 718 aa47.07■■■■■ 5.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.4 ms