RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479433.5

FBXO18-211, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 527 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-211ENST00000479433 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.93□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.93□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.93□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 TOM1O60784 492 aa9.92□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 PIP4K2BP78356 416 aa9.92□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 NUP155O75694 1391 aa9.91□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 KCNA6P17658 529 aa9.91□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 PTPRUQ92729 1446 aa9.9□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 EID1Q9Y6B2 187 aa9.9□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.9□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 SOCS7O14512 581 aa9.88□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 CLTCL1P53675 1640 aa9.88□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 HFM1A2PYH4 1435 aa9.88□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.88□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 TRPM2O94759 1503 aa9.87□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 ITGAEP38570 1179 aa9.87□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 TBX22Q9Y458 520 aa9.87□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.87□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.87□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 DIP2AQ14689 1571 aa9.86□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.85□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.85□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 METP08581 1390 aa9.84□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 PIK3R4Q99570 1358 aa9.84□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
FBXO18-211ENST00000479433 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.83□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.82□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 SLAIN2Q9P270 581 aa9.79□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.79□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 LRP6O75581 1613 aa9.78□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 MSH6P52701 1360 aa9.78□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.78□□□□□ -0.84
FBXO18-211ENST00000479433 MST1RQ04912 1400 aa9.77□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.77□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 DCCP43146 1447 aa9.76□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 FOXD1Q16676 465 aa9.76□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.76□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.75□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.75□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 POTEAQ6S8J7 498 aa9.75□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 BRINP3Q76B58 766 aa9.75□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.75□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 PHLPP1O60346 1717 aa9.75□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 PPLO60437 1756 aa9.75□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 PTCH1Q13635 1447 aa9.74□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.74□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 IFT172Q9UG01 1749 aa9.73□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 KIF1BO60333 1816 aa9.73□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 BCANQ96GW7 911 aa9.73□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 LAMC1P11047 1609 aa9.73□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.73□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 JCADQ9P266 1359 aa9.73□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 SHPRHQ149N8 1683 aa9.72□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.72□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.72□□□□□ -0.85
FBXO18-211ENST00000479433 EP400Q96L91 3159 aa9.71□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.71□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.71□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 TECPR2O15040 1411 aa9.71□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.71□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.7□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.7□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 PIK3C2GO75747 1445 aa9.69□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 TRIM52Q96A61 297 aa9.69□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.67□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 ATF3P18847 181 aa9.67□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.67□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.66□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.66□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.66□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.66□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.65□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 C14orf37Q86TY3 774 aa9.65□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 ORAI2Q96SN7 254 aa9.65□□□□□ -0.86
FBXO18-211ENST00000479433 MYOM2P54296 1465 aa9.65□□□□□ -0.87
FBXO18-211ENST00000479433 ABCC11Q96J66 1382 aa9.64□□□□□ -0.87
FBXO18-211ENST00000479433 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms