RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478150.1

STX4-208, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 4

Gene STX4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-208ENST00000478150 ADGRB3O60242 1522 aa27.02■■□□□ 1.92
STX4-208ENST00000478150 LTKP29376 864 aa26.99■■□□□ 1.91
STX4-208ENST00000478150 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
STX4-208ENST00000478150 TRIM52Q96A61 297 aa26.92■■□□□ 1.9
STX4-208ENST00000478150 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.9■■□□□ 1.9
STX4-208ENST00000478150 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
STX4-208ENST00000478150 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.88■■□□□ 1.89
STX4-208ENST00000478150 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.87■■□□□ 1.89
STX4-208ENST00000478150 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.87■■□□□ 1.89
STX4-208ENST00000478150 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
STX4-208ENST00000478150 ZFYVE9O95405 1425 aa26.85■■□□□ 1.89
STX4-208ENST00000478150 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.84■■□□□ 1.89
STX4-208ENST00000478150 KCNA6P17658 529 aa26.84■■□□□ 1.89
STX4-208ENST00000478150 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
STX4-208ENST00000478150 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 BCANQ96GW7 911 aa26.8■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 TMEM94Q12767 1356 aa26.8■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 TRPM2O94759 1503 aa26.8■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.78■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.77■■□□□ 1.88
STX4-208ENST00000478150 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.74■■□□□ 1.87
STX4-208ENST00000478150 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
STX4-208ENST00000478150 CLTCL1P53675 1640 aa26.74■■□□□ 1.87
STX4-208ENST00000478150 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
STX4-208ENST00000478150 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
STX4-208ENST00000478150 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 MSH6P52701 1360 aa26.69■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.68■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.67■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 KIF1BO60333 1816 aa26.67■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 TBX22Q9Y458 520 aa26.66■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 FOXD1Q16676 465 aa26.65■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 DIP2AQ14689 1571 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 NWD1Q149M9 1564 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 POTEAQ6S8J7 498 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 SLAIN2Q9P270 581 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-208ENST00000478150 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-208ENST00000478150 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-208ENST00000478150 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
STX4-208ENST00000478150 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.6■■□□□ 1.85
STX4-208ENST00000478150 JCADQ9P266 1359 aa26.59■■□□□ 1.85
STX4-208ENST00000478150 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
STX4-208ENST00000478150 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.58■■□□□ 1.85
STX4-208ENST00000478150 PIK3R4Q99570 1358 aa26.58■■□□□ 1.84
STX4-208ENST00000478150 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.57■■□□□ 1.84
STX4-208ENST00000478150 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.56■■□□□ 1.84
STX4-208ENST00000478150 PHLPP1O60346 1717 aa26.55■■□□□ 1.84
STX4-208ENST00000478150 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.55■■□□□ 1.84
STX4-208ENST00000478150 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-208ENST00000478150 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
STX4-208ENST00000478150 C14orf37Q86TY3 774 aa26.51■■□□□ 1.83
STX4-208ENST00000478150 HRCP23327 699 aa26.49■■□□□ 1.83
STX4-208ENST00000478150 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.48■■□□□ 1.83
STX4-208ENST00000478150 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.48■■□□□ 1.83
STX4-208ENST00000478150 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.47■■□□□ 1.83
STX4-208ENST00000478150 PPLO60437 1756 aa26.46■■□□□ 1.83
STX4-208ENST00000478150 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.46■■□□□ 1.83
STX4-208ENST00000478150 PTPRUQ92729 1446 aa26.46■■□□□ 1.83
STX4-208ENST00000478150 ATF3P18847 181 aa26.45■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.45■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 METP08581 1390 aa26.44■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 RGL3Q3MIN7 710 aa26.43■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.4■■□□□ 1.82
STX4-208ENST00000478150 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
STX4-208ENST00000478150 IFT172Q9UG01 1749 aa26.35■■□□□ 1.81
STX4-208ENST00000478150 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
STX4-208ENST00000478150 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
STX4-208ENST00000478150 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
STX4-208ENST00000478150 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.34■■□□□ 1.81
STX4-208ENST00000478150 SHPRHQ149N8 1683 aa26.31■■□□□ 1.8
STX4-208ENST00000478150 LRP6O75581 1613 aa26.31■■□□□ 1.8
STX4-208ENST00000478150 RXRBP28702 533 aa26.29■■□□□ 1.8
STX4-208ENST00000478150 DCCP43146 1447 aa26.29■■□□□ 1.8
STX4-208ENST00000478150 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
STX4-208ENST00000478150 PTCH1Q13635 1447 aa26.28■■□□□ 1.8
STX4-208ENST00000478150 BRINP3Q76B58 766 aa26.27■■□□□ 1.8
STX4-208ENST00000478150 PIK3C2GO75747 1445 aa26.27■■□□□ 1.8
STX4-208ENST00000478150 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.26■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 MYOM2P54296 1465 aa26.24■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.24■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.24■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.22■■□□□ 1.79
STX4-208ENST00000478150 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.19■■□□□ 1.78
STX4-208ENST00000478150 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
STX4-208ENST00000478150 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
STX4-208ENST00000478150 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.17■■□□□ 1.78
STX4-208ENST00000478150 AFF2P51816 1311 aa26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms