RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HOXB3-208	ENST00000476342	ZFYVE9	O95405	1425 aa		43.32	■■■■■ 4.53
HOXB3-208	ENST00000476342	LTK	P29376	864 aa		43.31	■■■■■ 4.52
HOXB3-208	ENST00000476342	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.31	■■■■■ 4.52
HOXB3-208	ENST00000476342	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
HOXB3-208	ENST00000476342	IQGAP1	P46940	1657 aa		43.28	■■■■■ 4.52
HOXB3-208	ENST00000476342	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.27	■■■■■ 4.52
HOXB3-208	ENST00000476342	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
HOXB3-208	ENST00000476342	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.23	■■■■■ 4.51
HOXB3-208	ENST00000476342	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		43.21	■■■■■ 4.51
HOXB3-208	ENST00000476342	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.19	■■■■■ 4.5
HOXB3-208	ENST00000476342	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.17	■■■■■ 4.5
HOXB3-208	ENST00000476342	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
HOXB3-208	ENST00000476342	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.13	■■■■■ 4.5
HOXB3-208	ENST00000476342	RGL3	Q3MIN7	710 aa		43.13	■■■■■ 4.49
HOXB3-208	ENST00000476342	PPL	O60437	1756 aa		43.12	■■■■■ 4.49
HOXB3-208	ENST00000476342	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.08	■■■■■ 4.49
HOXB3-208	ENST00000476342	IFT172	Q9UG01	1749 aa		43.05	■■■■■ 4.48
HOXB3-208	ENST00000476342	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
HOXB3-208	ENST00000476342	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.97	■■■■■ 4.47
HOXB3-208	ENST00000476342	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.97	■■■■■ 4.47
HOXB3-208	ENST00000476342	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		42.97	■■■■■ 4.47
HOXB3-208	ENST00000476342	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
HOXB3-208	ENST00000476342	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
HOXB3-208	ENST00000476342	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.93	■■■■■ 4.46
HOXB3-208	ENST00000476342	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.93	■■■■■ 4.46
HOXB3-208	ENST00000476342	TBX22	Q9Y458	520 aa		42.89	■■■■■ 4.46
HOXB3-208	ENST00000476342	MYOM2	P54296	1465 aa		42.89	■■■■■ 4.46
HOXB3-208	ENST00000476342	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		42.88	■■■■■ 4.46
HOXB3-208	ENST00000476342	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.86	■■■■■ 4.45
HOXB3-208	ENST00000476342	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.85	■■■■■ 4.45
HOXB3-208	ENST00000476342	NEUROD1	Q13562	356 aa		42.84	■■■■■ 4.45
HOXB3-208	ENST00000476342	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.83	■■■■■ 4.45
HOXB3-208	ENST00000476342	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.82	■■■■■ 4.45
HOXB3-208	ENST00000476342	CPS1	P31327	1500 aa		42.8	■■■■■ 4.44
HOXB3-208	ENST00000476342	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.79	■■■■■ 4.44
HOXB3-208	ENST00000476342	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.79	■■■■■ 4.44
HOXB3-208	ENST00000476342	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.79	■■■■■ 4.44
HOXB3-208	ENST00000476342	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.78	■■■■■ 4.44
HOXB3-208	ENST00000476342	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.77	■■■■■ 4.44
HOXB3-208	ENST00000476342	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
HOXB3-208	ENST00000476342	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.75	■■■■■ 4.43
HOXB3-208	ENST00000476342	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.75	■■■■■ 4.43
HOXB3-208	ENST00000476342	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
HOXB3-208	ENST00000476342	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		42.75	■■■■■ 4.43
HOXB3-208	ENST00000476342	KCNA6	P17658	529 aa		42.74	■■■■■ 4.43
HOXB3-208	ENST00000476342	LAMC1	P11047	1609 aa		42.69	■■■■■ 4.42
HOXB3-208	ENST00000476342	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	42.68	■■■■■ 4.42
HOXB3-208	ENST00000476342	MET	P08581	1390 aa		42.68	■■■■■ 4.42
HOXB3-208	ENST00000476342	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
HOXB3-208	ENST00000476342	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.66	■■■■■ 4.42
HOXB3-208	ENST00000476342	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		42.66	■■■■■ 4.42
HOXB3-208	ENST00000476342	TONSL	Q96HA7	1378 aa		42.63	■■■■■ 4.41
HOXB3-208	ENST00000476342	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.61	■■■■■ 4.41
HOXB3-208	ENST00000476342	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
HOXB3-208	ENST00000476342	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.6	■■■■■ 4.41
HOXB3-208	ENST00000476342	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.6	■■■■■ 4.41
HOXB3-208	ENST00000476342	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
HOXB3-208	ENST00000476342	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.59	■■■■■ 4.41
HOXB3-208	ENST00000476342	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.56	■■■■■ 4.4
HOXB3-208	ENST00000476342	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.53	■■■■■ 4.4
HOXB3-208	ENST00000476342	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.53	■■■■■ 4.4
HOXB3-208	ENST00000476342	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
HOXB3-208	ENST00000476342	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		42.49	■■■■■ 4.39
HOXB3-208	ENST00000476342	TMEM94	Q12767	1356 aa		42.48	■■■■■ 4.39
HOXB3-208	ENST00000476342	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
HOXB3-208	ENST00000476342	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.47	■■■■■ 4.39
HOXB3-208	ENST00000476342	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
HOXB3-208	ENST00000476342	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.45	■■■■■ 4.39
HOXB3-208	ENST00000476342	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
HOXB3-208	ENST00000476342	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.42	■■■■■ 4.38
HOXB3-208	ENST00000476342	ADGRB1	O14514	1584 aa		42.42	■■■■■ 4.38
HOXB3-208	ENST00000476342	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.41	■■■■■ 4.38
HOXB3-208	ENST00000476342	TECPR2	O15040	1411 aa		42.39	■■■■■ 4.38
HOXB3-208	ENST00000476342	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.39	■■■■■ 4.38
HOXB3-208	ENST00000476342	STK26	Q9P289	416 aa		42.38	■■■■■ 4.38
HOXB3-208	ENST00000476342	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		42.38	■■■■■ 4.38
HOXB3-208	ENST00000476342	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
HOXB3-208	ENST00000476342	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.35	■■■■■ 4.37
HOXB3-208	ENST00000476342	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		42.33	■■■■■ 4.37
HOXB3-208	ENST00000476342	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.32	■■■■■ 4.37
HOXB3-208	ENST00000476342	MSH6	P52701	1360 aa		42.3	■■■■■ 4.36
HOXB3-208	ENST00000476342	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.27	■■■■■ 4.36
HOXB3-208	ENST00000476342	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		42.26	■■■■■ 4.36
HOXB3-208	ENST00000476342	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.25	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		42.25	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	SIRT1	Q96EB6	747 aa		42.25	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.23	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	TOM1	O60784	492 aa		42.23	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.22	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		42.22	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.22	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.21	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.2	■■■■■ 4.35
HOXB3-208	ENST00000476342	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.18	■■■■■ 4.34
HOXB3-208	ENST00000476342	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		42.17	■■■■■ 4.34
HOXB3-208	ENST00000476342	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
HOXB3-208	ENST00000476342	DCC	P43146	1447 aa		42.17	■■■■■ 4.34
HOXB3-208	ENST00000476342	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.15	■■■■■ 4.34

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