RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467987.1

ESRRA-204, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-204ENST00000467987 ZFYVE9O95405 1425 aa41.39■■■■■ 4.22
ESRRA-204ENST00000467987 BCANQ96GW7 911 aa41.39■■■■■ 4.22
ESRRA-204ENST00000467987 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.38■■■■■ 4.22
ESRRA-204ENST00000467987 HSPA1LP34931 641 aa41.38■■■■■ 4.21
ESRRA-204ENST00000467987 KCNA6P17658 529 aa41.36■■■■■ 4.21
ESRRA-204ENST00000467987 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
ESRRA-204ENST00000467987 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
ESRRA-204ENST00000467987 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.32■■■■■ 4.21
ESRRA-204ENST00000467987 NAIPQ13075 1403 aa41.31■■■■■ 4.2
ESRRA-204ENST00000467987 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
ESRRA-204ENST00000467987 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
ESRRA-204ENST00000467987 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.24■■■■■ 4.19
ESRRA-204ENST00000467987 TMEM94Q12767 1356 aa41.24■■■■■ 4.19
ESRRA-204ENST00000467987 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
ESRRA-204ENST00000467987 NWD1Q149M9 1564 aa41.21■■■■■ 4.19
ESRRA-204ENST00000467987 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
ESRRA-204ENST00000467987 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
ESRRA-204ENST00000467987 TBX22Q9Y458 520 aa41.18■■■■■ 4.18
ESRRA-204ENST00000467987 HFM1A2PYH4 1435 aa41.18■■■■■ 4.18
ESRRA-204ENST00000467987 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
ESRRA-204ENST00000467987 ILDR2Q71H61 639 aa41.16■■■■■ 4.18
ESRRA-204ENST00000467987 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
ESRRA-204ENST00000467987 TRIM52Q96A61 297 aa41.11■■■■■ 4.17
ESRRA-204ENST00000467987 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.1■■■■■ 4.17
ESRRA-204ENST00000467987 DIP2AQ14689 1571 aa41.06■■■■■ 4.16
ESRRA-204ENST00000467987 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
ESRRA-204ENST00000467987 TRPM2O94759 1503 aa41.04■■■■■ 4.16
ESRRA-204ENST00000467987 CLTCL1P53675 1640 aa41.04■■■■■ 4.16
ESRRA-204ENST00000467987 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.01■■■■■ 4.15
ESRRA-204ENST00000467987 MSH6P52701 1360 aa41■■■■■ 4.15
ESRRA-204ENST00000467987 PIK3R4Q99570 1358 aa41■■■■■ 4.15
ESRRA-204ENST00000467987 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
ESRRA-204ENST00000467987 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
ESRRA-204ENST00000467987 KIF1BO60333 1816 aa40.96■■■■■ 4.15
ESRRA-204ENST00000467987 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.92■■■■■ 4.14
ESRRA-204ENST00000467987 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.91■■■■■ 4.14
ESRRA-204ENST00000467987 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.91■■■■■ 4.14
ESRRA-204ENST00000467987 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.9■■■■■ 4.14
ESRRA-204ENST00000467987 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.89■■■■■ 4.14
ESRRA-204ENST00000467987 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.88■■■■■ 4.14
ESRRA-204ENST00000467987 PTPRUQ92729 1446 aa40.87■■■■■ 4.13
ESRRA-204ENST00000467987 C14orf37Q86TY3 774 aa40.87■■■■■ 4.13
ESRRA-204ENST00000467987 SLAIN2Q9P270 581 aa40.87■■■■■ 4.13
ESRRA-204ENST00000467987 SOCS7O14512 581 aa40.84■■■■■ 4.13
ESRRA-204ENST00000467987 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.79■■■■■ 4.12
ESRRA-204ENST00000467987 METP08581 1390 aa40.77■■■■■ 4.12
ESRRA-204ENST00000467987 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
ESRRA-204ENST00000467987 FOXD1Q16676 465 aa40.77■■■■■ 4.12
ESRRA-204ENST00000467987 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
ESRRA-204ENST00000467987 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.11
ESRRA-204ENST00000467987 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.74■■■■■ 4.11
ESRRA-204ENST00000467987 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
ESRRA-204ENST00000467987 ATF3P18847 181 aa40.73■■■■■ 4.11
ESRRA-204ENST00000467987 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.72■■■■■ 4.11
ESRRA-204ENST00000467987 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.72■■■■■ 4.11
ESRRA-204ENST00000467987 PHLPP1O60346 1717 aa40.67■■■■■ 4.1
ESRRA-204ENST00000467987 PPLO60437 1756 aa40.63■■■■■ 4.1
ESRRA-204ENST00000467987 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
ESRRA-204ENST00000467987 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.62■■■■■ 4.09
ESRRA-204ENST00000467987 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.62■■■■■ 4.09
ESRRA-204ENST00000467987 DCCP43146 1447 aa40.59■■■■■ 4.09
ESRRA-204ENST00000467987 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
ESRRA-204ENST00000467987 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
ESRRA-204ENST00000467987 JCADQ9P266 1359 aa40.52■■■■■ 4.08
ESRRA-204ENST00000467987 RGL3Q3MIN7 710 aa40.52■■■■■ 4.08
ESRRA-204ENST00000467987 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.5■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.5■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 BRINP3Q76B58 766 aa40.49■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 MST1RQ04912 1400 aa40.46■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 PTCH1Q13635 1447 aa40.46■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.46■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.46■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.45■■■■■ 4.07
ESRRA-204ENST00000467987 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.43■■■■■ 4.06
ESRRA-204ENST00000467987 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.42■■■■■ 4.06
ESRRA-204ENST00000467987 IFT172Q9UG01 1749 aa40.42■■■■■ 4.06
ESRRA-204ENST00000467987 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.41■■■■■ 4.06
ESRRA-204ENST00000467987 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.4■■■■■ 4.06
ESRRA-204ENST00000467987 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.33■■■■■ 4.05
ESRRA-204ENST00000467987 SHPRHQ149N8 1683 aa40.31■■■■■ 4.04
ESRRA-204ENST00000467987 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.31■■■■■ 4.04
ESRRA-204ENST00000467987 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.27■■■■■ 4.04
ESRRA-204ENST00000467987 PIK3C2GO75747 1445 aa40.27■■■■■ 4.04
ESRRA-204ENST00000467987 POTEAQ6S8J7 498 aa40.27■■■■■ 4.04
ESRRA-204ENST00000467987 STK26Q9P289 416 aa40.25■■■■■ 4.03
ESRRA-204ENST00000467987 LRP6O75581 1613 aa40.24■■■■■ 4.03
ESRRA-204ENST00000467987 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.22■■■■■ 4.03
ESRRA-204ENST00000467987 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
ESRRA-204ENST00000467987 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
ESRRA-204ENST00000467987 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
ESRRA-204ENST00000467987 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
ESRRA-204ENST00000467987 TECPR2O15040 1411 aa40.19■■■■■ 4.02
ESRRA-204ENST00000467987 HRCP23327 699 aa40.19■■■■■ 4.02
ESRRA-204ENST00000467987 ABCC11Q96J66 1382 aa40.18■■■■■ 4.02
ESRRA-204ENST00000467987 ORAI2Q96SN7 254 aa40.17■■■■■ 4.02
ESRRA-204ENST00000467987 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.16■■■■■ 4.02
ESRRA-204ENST00000467987 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
ESRRA-204ENST00000467987 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.15■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms