RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464833.1

CHRD-211, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 5

Gene CHRD, Length 1,340 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-211ENST00000464833 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CHRD-211ENST00000464833 IQGAP1P46940 1657 aa40.66■■■■■ 4.1
CHRD-211ENST00000464833 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.6■■■■■ 4.09
CHRD-211ENST00000464833 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.58■■■■■ 4.09
CHRD-211ENST00000464833 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.08
CHRD-211ENST00000464833 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.56■■■■■ 4.08
CHRD-211ENST00000464833 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.56■■■■■ 4.08
CHRD-211ENST00000464833 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
CHRD-211ENST00000464833 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
CHRD-211ENST00000464833 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.51■■■■■ 4.08
CHRD-211ENST00000464833 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CHRD-211ENST00000464833 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CHRD-211ENST00000464833 PPLO60437 1756 aa40.48■■■■■ 4.07
CHRD-211ENST00000464833 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.46■■■■■ 4.07
CHRD-211ENST00000464833 IFT172Q9UG01 1749 aa40.43■■■■■ 4.06
CHRD-211ENST00000464833 RGL3Q3MIN7 710 aa40.41■■■■■ 4.06
CHRD-211ENST00000464833 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
CHRD-211ENST00000464833 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.39■■■■■ 4.06
CHRD-211ENST00000464833 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.37■■■■■ 4.05
CHRD-211ENST00000464833 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.37■■■■■ 4.05
CHRD-211ENST00000464833 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.36■■■■■ 4.05
CHRD-211ENST00000464833 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.35■■■■■ 4.05
CHRD-211ENST00000464833 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CHRD-211ENST00000464833 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CHRD-211ENST00000464833 BCANQ96GW7 911 aa40.34■■■■■ 4.05
CHRD-211ENST00000464833 DIP2AQ14689 1571 aa40.33■■■■■ 4.05
CHRD-211ENST00000464833 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.3■■■■■ 4.04
CHRD-211ENST00000464833 TBX22Q9Y458 520 aa40.28■■■■■ 4.04
CHRD-211ENST00000464833 MYOM2P54296 1465 aa40.23■■■■■ 4.03
CHRD-211ENST00000464833 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.23■■■■■ 4.03
CHRD-211ENST00000464833 CPS1P31327 1500 aa40.23■■■■■ 4.03
CHRD-211ENST00000464833 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
CHRD-211ENST00000464833 NWD1Q149M9 1564 aa40.2■■■■■ 4.03
CHRD-211ENST00000464833 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.19■■■■■ 4.02
CHRD-211ENST00000464833 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
CHRD-211ENST00000464833 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.18■■■■■ 4.02
CHRD-211ENST00000464833 PIK3R4Q99570 1358 aa40.17■■■■■ 4.02
CHRD-211ENST00000464833 ALKQ9UM73 1620 aa40.17■■■■■ 4.02
CHRD-211ENST00000464833 PIK3C2GO75747 1445 aa40.16■■■■■ 4.02
CHRD-211ENST00000464833 KCNA6P17658 529 aa40.16■■■■■ 4.02
CHRD-211ENST00000464833 CERKQ8TCT0 537 aa40.16■■■■■ 4.02
CHRD-211ENST00000464833 METP08581 1390 aa40.11■■■■■ 4.01
CHRD-211ENST00000464833 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.11■■■■■ 4.01
CHRD-211ENST00000464833 STAC3Q96MF2 364 aa40.09■■■■■ 4.01
CHRD-211ENST00000464833 PTPRUQ92729 1446 aa40.09■■■■■ 4.01
CHRD-211ENST00000464833 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
CHRD-211ENST00000464833 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.08■■■■■ 4.01
CHRD-211ENST00000464833 NEUROD1Q13562 356 aa40.07■■■■■ 4
CHRD-211ENST00000464833 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.07■■■■■ 4
CHRD-211ENST00000464833 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
CHRD-211ENST00000464833 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.04■■■■■ 4
CHRD-211ENST00000464833 LAMC1P11047 1609 aa40.02■■■■■ 4
CHRD-211ENST00000464833 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
CHRD-211ENST00000464833 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.99■■■■□ 3.99
CHRD-211ENST00000464833 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.98■■■■□ 3.99
CHRD-211ENST00000464833 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
CHRD-211ENST00000464833 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.97■■■■□ 3.99
CHRD-211ENST00000464833 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.94■■■■□ 3.98
CHRD-211ENST00000464833 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.92■■■■□ 3.98
CHRD-211ENST00000464833 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
CHRD-211ENST00000464833 TMEM94Q12767 1356 aa39.92■■■■□ 3.98
CHRD-211ENST00000464833 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.91■■■■□ 3.98
CHRD-211ENST00000464833 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.86■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 ADGRB1O14514 1584 aa39.85■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 PTCH1Q13635 1447 aa39.85■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 TONSLQ96HA7 1378 aa39.84■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa39.84■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.83■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 TECPR2O15040 1411 aa39.82■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa39.82■■■■□ 3.97
CHRD-211ENST00000464833 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.96
CHRD-211ENST00000464833 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
CHRD-211ENST00000464833 ABCC11Q96J66 1382 aa39.8■■■■□ 3.96
CHRD-211ENST00000464833 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.8■■■■□ 3.96
CHRD-211ENST00000464833 FBXO41Q8TF61 875 aa39.75■■■■□ 3.95
CHRD-211ENST00000464833 STK26Q9P289 416 aa39.75■■■■□ 3.95
CHRD-211ENST00000464833 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.69■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.69■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 MSH6P52701 1360 aa39.69■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.67■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 DLC1Q96QB1 1528 aa39.67■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.66■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.66■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 C14orf37Q86TY3 774 aa39.65■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 TOM1O60784 492 aa39.65■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 NBPF1Q3BBV0 1214 aa39.65■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.65■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 SIRT1Q96EB6 747 aa39.65■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.64■■■■□ 3.94
CHRD-211ENST00000464833 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.62■■■■□ 3.93
CHRD-211ENST00000464833 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.61■■■■□ 3.93
CHRD-211ENST00000464833 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.6■■■■□ 3.93
CHRD-211ENST00000464833 DCCP43146 1447 aa39.6■■■■□ 3.93
CHRD-211ENST00000464833 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
CHRD-211ENST00000464833 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.57■■■■□ 3.92
CHRD-211ENST00000464833 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
CHRD-211ENST00000464833 PRAM1Q96QH2 718 aa39.53■■■■□ 3.92
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