RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CERKQ8TCT0 537 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLR3EQ9NVU0 708 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.84□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POM121Q96HA1 1249 aa13.83□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 JPH4Q96JJ6 628 aa13.83□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINA10Q9UK55 444 aa13.83□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.82□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DIXDC1Q155Q3 683 aa13.82□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BANK1Q8NDB2 785 aa13.82□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PXYLP1Q8TE99 480 aa13.82□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC39A7Q92504 469 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRG1Q9Y653 693 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF27Q86VH2 1401 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAMTS12P58397 1594 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM161AQ3B820 660 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PADI6Q6TGC4 694 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNJ2O15056 1496 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGF1RP08069 1367 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLRP7Q8WX94 980 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COG6Q9Y2V7 657 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C7P10643 843 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC13Q8NBP0 860 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POTEFA5A3E0 1075 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RFC5P40937 340 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRIN2AQ12879 1464 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOSBP53539 338 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM259Q4ZIN3 620 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAIPQ9BWF2 469 aa13.72□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.72□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP2R2DQ66LE6 453 aa13.71□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NECTIN2Q92692 538 aa13.71□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNRKQ9NRH2 765 aa13.71□□□□□ -0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP170Q5SW79 1584 aa13.71□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GABBR2O75899 941 aa13.7□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.7□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CUL7Q14999 1698 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRSS12P56730 875 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METRNQ9UJH8 293 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUP160Q12769 1436 aa13.65□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.65□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.65□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.65□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCTD17Q8N5Z5 321 aa13.65□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.65□□□□□ -0.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGEF11O15085 1522 aa13.64□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOCS7O14512 581 aa13.64□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WWC1Q8IX03 1113 aa13.64□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPIRE2Q8WWL2 714 aa13.64□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.63□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPTLC1O15269 473 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRM3Q9NNZ6 103 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD46P15529 392 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SULF1Q8IWU6 871 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RCCD1A6NED2 376 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GJA5P36382 358 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.57□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.57□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARAP1Q96P48 1450 aa13.56□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRXQ9BXM0 1461 aa13.56□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EYA1Q99502 592 aa13.56□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RETREG2Q8NC44 543 aa13.54□□□□□ -0.24
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