RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

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Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.15□□□□□ -0.31
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GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF1BO60333 1816 aa13.13□□□□□ -0.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOM1O60784 492 aa13.13□□□□□ -0.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIP4K2BP78356 416 aa13.13□□□□□ -0.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.08□□□□□ -0.32
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.06□□□□□ -0.32
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PPLO60437 1756 aa13.04□□□□□ -0.32
GAPDHP28-201ENST00000455134 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.03□□□□□ -0.32
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.03□□□□□ -0.32
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPM2O94759 1503 aa13.03□□□□□ -0.32
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.03□□□□□ -0.32
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GAPDHP28-201ENST00000455134 NUP155O75694 1391 aa13.02□□□□□ -0.33
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFT172Q9UG01 1749 aa13.02□□□□□ -0.33
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GAPDHP28-201ENST00000455134 NAIPQ13075 1403 aa13.01□□□□□ -0.33
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GAPDHP28-201ENST00000455134 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.99□□□□□ -0.33
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GAPDHP28-201ENST00000455134 TBX22Q9Y458 520 aa12.97□□□□□ -0.33
GAPDHP28-201ENST00000455134 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3R4Q99570 1358 aa12.95□□□□□ -0.34
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GAPDHP28-201ENST00000455134 HFM1A2PYH4 1435 aa12.94□□□□□ -0.34
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GAPDHP28-201ENST00000455134 METP08581 1390 aa12.89□□□□□ -0.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCCP43146 1447 aa12.88□□□□□ -0.35
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.88□□□□□ -0.35
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GAPDHP28-201ENST00000455134 POTEAQ6S8J7 498 aa12.83□□□□□ -0.36
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa12.8□□□□□ -0.36
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ROBO2Q9HCK4 1378 aa12.79□□□□□ -0.36
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GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.76□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.75□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCA3Q99758 1704 aa12.74□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC144AA2RUR9 1427 aa12.74□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TECPR2O15040 1411 aa12.74□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3C2GO75747 1445 aa12.73□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa12.73□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRXN1Q9ULB1 1477 aa12.72□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.72□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF1AQ12756 1690 aa12.72□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP32Q8NFA0 1604 aa12.71□□□□□ -0.37
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