RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		21.62	■■□□□ 1.05
PTPA-222	ENST00000445241	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		21.58	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	FOXD1	Q16676	465 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	DIP2A	Q14689	1571 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	CPS1	P31327	1500 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
PTPA-222	ENST00000445241	PPL	O60437	1756 aa		21.51	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		21.51	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		21.49	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	IFT172	Q9UG01	1749 aa		21.47	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	CERK	Q8TCT0	537 aa		21.47	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	TBX22	Q9Y458	520 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3R4	Q99570	1358 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PTPA-222	ENST00000445241	NWD1	Q149M9	1564 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	BCAN	Q96GW7	911 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	KCNA6	P17658	529 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PTPA-222	ENST00000445241	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	STAC3	Q96MF2	364 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	MYOM2	P54296	1465 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	RGL3	Q3MIN7	710 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	ALK	Q9UM73	1620 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO41	Q8TF61	875 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3C2G	O75747	1445 aa		21.32	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	LAMC1	P11047	1609 aa		21.32	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		21.31	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	MET	P08581	1390 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	PTPRU	Q92729	1446 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPA-222	ENST00000445241	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM94	Q12767	1356 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	PTCH1	Q13635	1447 aa		21.23	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		21.22	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		21.21	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	TOM1	O60784	492 aa		21.21	■□□□□ 0.99
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		21.19	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	TECPR2	O15040	1411 aa		21.19	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		21.18	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	MSH6	P52701	1360 aa		21.18	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		21.18	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	21.17	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		21.17	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	DCC	P43146	1447 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	ABCC11	Q96J66	1382 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.98
PTPA-222	ENST00000445241	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		21.14	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		21.14	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	SIRT1	Q96EB6	747 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRB1	O14514	1584 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	DLC1	Q96QB1	1528 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	NEUROD1	Q13562	356 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	C14orf37	Q86TY3	774 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PTPA-222	ENST00000445241	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	21.06	■□□□□ 0.96
PTPA-222	ENST00000445241	TONSL	Q96HA7	1378 aa		21.06	■□□□□ 0.96
PTPA-222	ENST00000445241	ATF3	P18847	181 aa		21.05	■□□□□ 0.96
PTPA-222	ENST00000445241	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PTPA-222	ENST00000445241	STK26	Q9P289	416 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PTPA-222	ENST00000445241	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PTPA-222	ENST00000445241	SLAIN2	Q9P270	581 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PTPA-222	ENST00000445241	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PTPA-222	ENST00000445241	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	21.01	■□□□□ 0.95
PTPA-222	ENST00000445241	PIP4K2B	P78356	416 aa		21	■□□□□ 0.95
PTPA-222	ENST00000445241	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	20.99	■□□□□ 0.95

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