RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 A2MP01023 1474 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 IGHDP01880 384 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRJ-202ENST00000440289 C8orf34Q49A92 452 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-202ENST00000440289 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-202ENST00000440289 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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PTPRJ-202ENST00000440289 TNNQ9UQP3 1299 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCC2Q92887 1545 aa23.62■■□□□ 1.37
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PTPRJ-202ENST00000440289 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-202ENST00000440289 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.61■■□□□ 1.37
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PTPRJ-202ENST00000440289 USP35Q9P2H5 1018 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-202ENST00000440289 PREX2Q70Z35 1606 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-202ENST00000440289 SEC24BO95487 1268 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRJ-202ENST00000440289 SHROOM2Q13796 1616 aa23.58■■□□□ 1.36
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PTPRJ-202ENST00000440289 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.56■■□□□ 1.36
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PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.47■■□□□ 1.35
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PTPRJ-202ENST00000440289 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
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PTPRJ-202ENST00000440289 WWC1Q8IX03 1113 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRJ-202ENST00000440289 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTPRJ-202ENST00000440289 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-202ENST00000440289 E9PCH4 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
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PTPRJ-202ENST00000440289 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.31■■□□□ 1.32
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PTPRJ-202ENST00000440289 FANCAO15360 1455 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRJ-202ENST00000440289 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-202ENST00000440289 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-202ENST00000440289 UNC13BO14795 1591 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-202ENST00000440289 ASXL2Q76L83 1435 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTPRJ-202ENST00000440289 RUNDC1Q96C34 613 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-202ENST00000440289 CFAP53Q96M91 514 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-202ENST00000440289 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 USP19O94966 1318 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 PDE3AQ14432 1141 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 PLXNC1O60486 1568 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 FBLN1P23142 703 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP10AO60312 1499 aa23.24■■□□□ 1.31
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