RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438616.3

ARTN-204, Transcript of artemin, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARTN, Length 889 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARTN-204	ENST00000438616	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.99	■■■■■ 4.47
ARTN-204	ENST00000438616	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
ARTN-204	ENST00000438616		E9PCH4	1651 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ARTN-204	ENST00000438616	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.92	■■■■■ 4.46
ARTN-204	ENST00000438616	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.89	■■■■■ 4.46
ARTN-204	ENST00000438616	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		42.89	■■■■■ 4.46
ARTN-204	ENST00000438616	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
ARTN-204	ENST00000438616	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.89	■■■■■ 4.46
ARTN-204	ENST00000438616	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.46
ARTN-204	ENST00000438616	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		42.87	■■■■■ 4.45
ARTN-204	ENST00000438616	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
ARTN-204	ENST00000438616	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
ARTN-204	ENST00000438616	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.84	■■■■■ 4.45
ARTN-204	ENST00000438616	BCAN	Q96GW7	911 aa		42.82	■■■■■ 4.45
ARTN-204	ENST00000438616	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
ARTN-204	ENST00000438616	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
ARTN-204	ENST00000438616	ITGAE	P38570	1179 aa		42.74	■■■■■ 4.43
ARTN-204	ENST00000438616	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
ARTN-204	ENST00000438616	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
ARTN-204	ENST00000438616	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ARTN-204	ENST00000438616	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
ARTN-204	ENST00000438616	NUP155	O75694	1391 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ARTN-204	ENST00000438616	TBX22	Q9Y458	520 aa		42.69	■■■■■ 4.42
ARTN-204	ENST00000438616	MSH6	P52701	1360 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ARTN-204	ENST00000438616	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
ARTN-204	ENST00000438616	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	42.64	■■■■■ 4.42
ARTN-204	ENST00000438616	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.61	■■■■■ 4.41
ARTN-204	ENST00000438616	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.61	■■■■■ 4.41
ARTN-204	ENST00000438616	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.57	■■■■■ 4.41
ARTN-204	ENST00000438616	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.57	■■■■■ 4.4
ARTN-204	ENST00000438616	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ARTN-204	ENST00000438616	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ARTN-204	ENST00000438616	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ARTN-204	ENST00000438616	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
ARTN-204	ENST00000438616	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.51	■■■■■ 4.4
ARTN-204	ENST00000438616	TRPM2	O94759	1503 aa		42.48	■■■■■ 4.39
ARTN-204	ENST00000438616	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
ARTN-204	ENST00000438616	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.45	■■■■■ 4.39
ARTN-204	ENST00000438616	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
ARTN-204	ENST00000438616	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ARTN-204	ENST00000438616	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.41	■■■■■ 4.38
ARTN-204	ENST00000438616	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ARTN-204	ENST00000438616	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
ARTN-204	ENST00000438616	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ARTN-204	ENST00000438616	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ARTN-204	ENST00000438616	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ARTN-204	ENST00000438616	NAIP	Q13075	1403 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ARTN-204	ENST00000438616	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
ARTN-204	ENST00000438616	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.33	■■■■■ 4.37
ARTN-204	ENST00000438616	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.32	■■■■■ 4.37
ARTN-204	ENST00000438616	MET	P08581	1390 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ARTN-204	ENST00000438616	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
ARTN-204	ENST00000438616	LRP6	O75581	1613 aa		42.28	■■■■■ 4.36
ARTN-204	ENST00000438616	ATF3	P18847	181 aa		42.28	■■■■■ 4.36
ARTN-204	ENST00000438616	KIF1B	O60333	1816 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ARTN-204	ENST00000438616	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ARTN-204	ENST00000438616	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.21	■■■■■ 4.35
ARTN-204	ENST00000438616	DCC	P43146	1447 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ARTN-204	ENST00000438616	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
ARTN-204	ENST00000438616	MST1R	Q04912	1400 aa		42.16	■■■■■ 4.34
ARTN-204	ENST00000438616	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.15	■■■■■ 4.34
ARTN-204	ENST00000438616	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ARTN-204	ENST00000438616	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ARTN-204	ENST00000438616	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.13	■■■■■ 4.33
ARTN-204	ENST00000438616	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.09	■■■■■ 4.33
ARTN-204	ENST00000438616	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.07	■■■■■ 4.33
ARTN-204	ENST00000438616	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.05	■■■■■ 4.32
ARTN-204	ENST00000438616	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42	■■■■■ 4.31
ARTN-204	ENST00000438616	PPL	O60437	1756 aa		41.99	■■■■■ 4.31
ARTN-204	ENST00000438616	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
ARTN-204	ENST00000438616	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
ARTN-204	ENST00000438616	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
ARTN-204	ENST00000438616	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ARTN-204	ENST00000438616	PTCH1	Q13635	1447 aa		41.94	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	FOXD1	Q16676	465 aa		41.91	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		41.9	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		41.89	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		41.89	■■■■■ 4.3
ARTN-204	ENST00000438616	LAMC1	P11047	1609 aa		41.85	■■■■■ 4.29
ARTN-204	ENST00000438616	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		41.84	■■■■■ 4.29
ARTN-204	ENST00000438616	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	41.83	■■■■■ 4.29
ARTN-204	ENST00000438616	ORAI2	Q96SN7	254 aa		41.78	■■■■■ 4.28
ARTN-204	ENST00000438616	AFF2	P51816	1311 aa		41.77	■■■■■ 4.28
ARTN-204	ENST00000438616	IFT172	Q9UG01	1749 aa		41.75	■■■■■ 4.27
ARTN-204	ENST00000438616	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		41.74	■■■■■ 4.27
ARTN-204	ENST00000438616	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		41.73	■■■■■ 4.27
ARTN-204	ENST00000438616	RXRB	P28702	533 aa		41.71	■■■■■ 4.27
ARTN-204	ENST00000438616	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		41.69	■■■■■ 4.26
ARTN-204	ENST00000438616	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	41.69	■■■■■ 4.26
ARTN-204	ENST00000438616	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	41.67	■■■■■ 4.26
ARTN-204	ENST00000438616	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		41.67	■■■■■ 4.26
ARTN-204	ENST00000438616	C8orf37	Q96NL8	207 aa		41.66	■■■■■ 4.26
ARTN-204	ENST00000438616	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	41.66	■■■■■ 4.26
ARTN-204	ENST00000438616	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		41.64	■■■■■ 4.26
ARTN-204	ENST00000438616	RGL3	Q3MIN7	710 aa		41.64	■■■■■ 4.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms