RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SGO1-208ENST00000437051 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.42■■■□□ 2.14
SGO1-208ENST00000437051 NUP155O75694 1391 aa28.4■■■□□ 2.14
SGO1-208ENST00000437051 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.4■■■□□ 2.14
SGO1-208ENST00000437051 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.37■■■□□ 2.13
SGO1-208ENST00000437051 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SGO1-208ENST00000437051 KCNA6P17658 529 aa28.36■■■□□ 2.13
SGO1-208ENST00000437051 TMEM94Q12767 1356 aa28.36■■■□□ 2.13
SGO1-208ENST00000437051 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SGO1-208ENST00000437051 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
SGO1-208ENST00000437051 NAIPQ13075 1403 aa28.33■■■□□ 2.13
SGO1-208ENST00000437051 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
SGO1-208ENST00000437051 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.32■■■□□ 2.12
SGO1-208ENST00000437051 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SGO1-208ENST00000437051 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.31■■■□□ 2.12
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SGO1-208ENST00000437051 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.25■■■□□ 2.11
SGO1-208ENST00000437051 CLTCL1P53675 1640 aa28.24■■■□□ 2.11
SGO1-208ENST00000437051 DIP2AQ14689 1571 aa28.22■■■□□ 2.11
SGO1-208ENST00000437051 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SGO1-208ENST00000437051 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.21■■■□□ 2.11
SGO1-208ENST00000437051 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SGO1-208ENST00000437051 TBX22Q9Y458 520 aa28.21■■■□□ 2.11
SGO1-208ENST00000437051 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.2■■■□□ 2.11
SGO1-208ENST00000437051 SOCS7O14512 581 aa28.2■■■□□ 2.1
SGO1-208ENST00000437051 HFM1A2PYH4 1435 aa28.19■■■□□ 2.1
SGO1-208ENST00000437051 TRPM2O94759 1503 aa28.19■■■□□ 2.1
SGO1-208ENST00000437051 BCANQ96GW7 911 aa28.19■■■□□ 2.1
SGO1-208ENST00000437051 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
SGO1-208ENST00000437051 PTPRUQ92729 1446 aa28.18■■■□□ 2.1
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SGO1-208ENST00000437051 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.15■■■□□ 2.1
SGO1-208ENST00000437051 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.14■■■□□ 2.1
SGO1-208ENST00000437051 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SGO1-208ENST00000437051 PIK3R4Q99570 1358 aa28.11■■■□□ 2.09
SGO1-208ENST00000437051 MSH6P52701 1360 aa28.1■■■□□ 2.09
SGO1-208ENST00000437051 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
SGO1-208ENST00000437051 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.07■■■□□ 2.08
SGO1-208ENST00000437051 KIF1BO60333 1816 aa28.04■■■□□ 2.08
SGO1-208ENST00000437051 METP08581 1390 aa28.03■■■□□ 2.08
SGO1-208ENST00000437051 SLAIN2Q9P270 581 aa28.02■■■□□ 2.08
SGO1-208ENST00000437051 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SGO1-208ENST00000437051 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.01■■■□□ 2.07
SGO1-208ENST00000437051 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SGO1-208ENST00000437051 PHLPP1O60346 1717 aa28■■■□□ 2.07
SGO1-208ENST00000437051 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SGO1-208ENST00000437051 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SGO1-208ENST00000437051 TRIM52Q96A61 297 aa27.98■■■□□ 2.07
SGO1-208ENST00000437051 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SGO1-208ENST00000437051 FOXD1Q16676 465 aa27.93■■■□□ 2.06
SGO1-208ENST00000437051 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.93■■■□□ 2.06
SGO1-208ENST00000437051 PPLO60437 1756 aa27.93■■■□□ 2.06
SGO1-208ENST00000437051 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
SGO1-208ENST00000437051 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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SGO1-208ENST00000437051 C14orf37Q86TY3 774 aa27.88■■■□□ 2.05
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SGO1-208ENST00000437051 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.84■■■□□ 2.05
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SGO1-208ENST00000437051 ATF3P18847 181 aa27.83■■■□□ 2.05
SGO1-208ENST00000437051 BRINP3Q76B58 766 aa27.83■■■□□ 2.05
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SGO1-208ENST00000437051 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.82■■■□□ 2.04
SGO1-208ENST00000437051 PTCH1Q13635 1447 aa27.81■■■□□ 2.04
SGO1-208ENST00000437051 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.81■■■□□ 2.04
SGO1-208ENST00000437051 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.8■■■□□ 2.04
SGO1-208ENST00000437051 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.8■■■□□ 2.04
SGO1-208ENST00000437051 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.8■■■□□ 2.04
SGO1-208ENST00000437051 SHPRHQ149N8 1683 aa27.8■■■□□ 2.04
SGO1-208ENST00000437051 POTEAQ6S8J7 498 aa27.79■■■□□ 2.04
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SGO1-208ENST00000437051 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.74■■■□□ 2.03
SGO1-208ENST00000437051 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.72■■■□□ 2.03
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SGO1-208ENST00000437051 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.69■■■□□ 2.02
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SGO1-208ENST00000437051 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
SGO1-208ENST00000437051 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.58■■■□□ 2.01
SGO1-208ENST00000437051 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.57■■■□□ 2
SGO1-208ENST00000437051 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.55■■■□□ 2
SGO1-208ENST00000437051 MYOM2P54296 1465 aa27.55■■■□□ 2
SGO1-208ENST00000437051 ABCC11Q96J66 1382 aa27.54■■■□□ 2
SGO1-208ENST00000437051 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.53■■■□□ 2
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