RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.53■■■■■ 4.08
UPP1-208ENST00000436673 ITGAEP38570 1179 aa40.53■■■■■ 4.08
UPP1-208ENST00000436673 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.52■■■■■ 4.08
UPP1-208ENST00000436673 BCANQ96GW7 911 aa40.52■■■■■ 4.08
UPP1-208ENST00000436673 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.52■■■■■ 4.08
UPP1-208ENST00000436673 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.51■■■■■ 4.08
UPP1-208ENST00000436673 E9PCH4 1651 aa40.51■■■■■ 4.08
UPP1-208ENST00000436673 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
UPP1-208ENST00000436673 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.49■■■■■ 4.07
UPP1-208ENST00000436673 NWD1Q149M9 1564 aa40.49■■■■■ 4.07
UPP1-208ENST00000436673 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
UPP1-208ENST00000436673 NUP155O75694 1391 aa40.48■■■■■ 4.07
UPP1-208ENST00000436673 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
UPP1-208ENST00000436673 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
UPP1-208ENST00000436673 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
UPP1-208ENST00000436673 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.44■■■■■ 4.06
UPP1-208ENST00000436673 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
UPP1-208ENST00000436673 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.41■■■■■ 4.06
UPP1-208ENST00000436673 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
UPP1-208ENST00000436673 TBX22Q9Y458 520 aa40.37■■■■■ 4.05
UPP1-208ENST00000436673 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
UPP1-208ENST00000436673 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
UPP1-208ENST00000436673 MSH6P52701 1360 aa40.32■■■■■ 4.04
UPP1-208ENST00000436673 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.3■■■■■ 4.04
UPP1-208ENST00000436673 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.27■■■■■ 4.04
UPP1-208ENST00000436673 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
UPP1-208ENST00000436673 DIP2AQ14689 1571 aa40.23■■■■■ 4.03
UPP1-208ENST00000436673 SLAIN2Q9P270 581 aa40.21■■■■■ 4.03
UPP1-208ENST00000436673 PIK3R4Q99570 1358 aa40.21■■■■■ 4.03
UPP1-208ENST00000436673 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.2■■■■■ 4.03
UPP1-208ENST00000436673 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.16■■■■■ 4.02
UPP1-208ENST00000436673 NAIPQ13075 1403 aa40.14■■■■■ 4.02
UPP1-208ENST00000436673 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
UPP1-208ENST00000436673 TRPM2O94759 1503 aa40.11■■■■■ 4.01
UPP1-208ENST00000436673 C14orf37Q86TY3 774 aa40.09■■■■■ 4.01
UPP1-208ENST00000436673 PTPRUQ92729 1446 aa40.08■■■■■ 4.01
UPP1-208ENST00000436673 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.07■■■■■ 4.01
UPP1-208ENST00000436673 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
UPP1-208ENST00000436673 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.06■■■■■ 4
UPP1-208ENST00000436673 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.05■■■■■ 4
UPP1-208ENST00000436673 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.04■■■■■ 4
UPP1-208ENST00000436673 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.03■■■■■ 4
UPP1-208ENST00000436673 PHLPP1O60346 1717 aa40.01■■■■■ 4
UPP1-208ENST00000436673 CLTCL1P53675 1640 aa40.01■■■■■ 4
UPP1-208ENST00000436673 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
UPP1-208ENST00000436673 ATF3P18847 181 aa39.99■■■■□ 3.99
UPP1-208ENST00000436673 HFM1A2PYH4 1435 aa39.97■■■■□ 3.99
UPP1-208ENST00000436673 JCADQ9P266 1359 aa39.97■■■■□ 3.99
UPP1-208ENST00000436673 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa39.94■■■■□ 3.98
UPP1-208ENST00000436673 METP08581 1390 aa39.94■■■■□ 3.98
UPP1-208ENST00000436673 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
UPP1-208ENST00000436673 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
UPP1-208ENST00000436673 TRIM52Q96A61 297 aa39.91■■■■□ 3.98
UPP1-208ENST00000436673 DCCP43146 1447 aa39.88■■■■□ 3.97
UPP1-208ENST00000436673 POTEAQ6S8J7 498 aa39.87■■■■□ 3.97
UPP1-208ENST00000436673 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
UPP1-208ENST00000436673 KIF1BO60333 1816 aa39.84■■■■□ 3.97
UPP1-208ENST00000436673 BRINP3Q76B58 766 aa39.83■■■■□ 3.97
UPP1-208ENST00000436673 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
UPP1-208ENST00000436673 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.77■■■■□ 3.96
UPP1-208ENST00000436673 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
UPP1-208ENST00000436673 MST1RQ04912 1400 aa39.75■■■■□ 3.95
UPP1-208ENST00000436673 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.73■■■■□ 3.95
UPP1-208ENST00000436673 LRP6O75581 1613 aa39.73■■■■□ 3.95
UPP1-208ENST00000436673 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.72■■■■□ 3.95
UPP1-208ENST00000436673 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.72■■■■□ 3.95
UPP1-208ENST00000436673 SHPRHQ149N8 1683 aa39.69■■■■□ 3.94
UPP1-208ENST00000436673 FOXD1Q16676 465 aa39.65■■■■□ 3.94
UPP1-208ENST00000436673 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
UPP1-208ENST00000436673 PTCH1Q13635 1447 aa39.65■■■■□ 3.94
UPP1-208ENST00000436673 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.64■■■■□ 3.94
UPP1-208ENST00000436673 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
UPP1-208ENST00000436673 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.61■■■■□ 3.93
UPP1-208ENST00000436673 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.6■■■■□ 3.93
UPP1-208ENST00000436673 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.59■■■■□ 3.93
UPP1-208ENST00000436673 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.59■■■■□ 3.93
UPP1-208ENST00000436673 PPLO60437 1756 aa39.59■■■■□ 3.93
UPP1-208ENST00000436673 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.54■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.53■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.53■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
UPP1-208ENST00000436673 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.48■■■■□ 3.91
UPP1-208ENST00000436673 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.47■■■■□ 3.91
UPP1-208ENST00000436673 RGL3Q3MIN7 710 aa39.45■■■■□ 3.91
UPP1-208ENST00000436673 PNPLA6Q8IY17 1366 aa39.43■■■■□ 3.9
UPP1-208ENST00000436673 ORAI2Q96SN7 254 aa39.41■■■■□ 3.9
UPP1-208ENST00000436673 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.41■■■■□ 3.9
UPP1-208ENST00000436673 LAMC1P11047 1609 aa39.4■■■■□ 3.9
UPP1-208ENST00000436673 AFF2P51816 1311 aa39.36■■■■□ 3.89
UPP1-208ENST00000436673 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
UPP1-208ENST00000436673 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
UPP1-208ENST00000436673 IFT172Q9UG01 1749 aa39.34■■■■□ 3.89
UPP1-208ENST00000436673 RXRBP28702 533 aa39.33■■■■□ 3.89
UPP1-208ENST00000436673 TECPR2O15040 1411 aa39.32■■■■□ 3.89
UPP1-208ENST00000436673 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.31■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms