RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 TMEM94Q12767 1356 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 ZFYVE9O95405 1425 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 NUP155O75694 1391 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.553e-11■■■■□ 24.1
ACTB-205ENST00000432588 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 E9PCH4 1651 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-205ENST00000432588 NWD1Q149M9 1564 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-205ENST00000432588 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-205ENST00000432588 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-205ENST00000432588 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-205ENST00000432588 MSH6P52701 1360 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-205ENST00000432588 TBX22Q9Y458 520 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-205ENST00000432588 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ACTB-205ENST00000432588 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ACTB-205ENST00000432588 DIP2AQ14689 1571 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-205ENST00000432588 PIK3R4Q99570 1358 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-205ENST00000432588 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-205ENST00000432588 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-205ENST00000432588 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-205ENST00000432588 SLAIN2Q9P270 581 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-205ENST00000432588 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-205ENST00000432588 C14orf37Q86TY3 774 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-205ENST00000432588 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-205ENST00000432588 TRPM2O94759 1503 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-205ENST00000432588 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ACTB-205ENST00000432588 NAIPQ13075 1403 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-205ENST00000432588 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-205ENST00000432588 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-205ENST00000432588 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-205ENST00000432588 ATF3P18847 181 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-205ENST00000432588 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 PHLPP1O60346 1717 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 PTPRUQ92729 1446 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 TRIM52Q96A61 297 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 CLTCL1P53675 1640 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 HFM1A2PYH4 1435 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 JCADQ9P266 1359 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.39■■□□□ 1.5
ACTB-205ENST00000432588 DCCP43146 1447 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-205ENST00000432588 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-205ENST00000432588 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ACTB-205ENST00000432588 METP08581 1390 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-205ENST00000432588 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ACTB-205ENST00000432588 KIF1BO60333 1816 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-205ENST00000432588 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
ACTB-205ENST00000432588 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-205ENST00000432588 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-205ENST00000432588 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-205ENST00000432588 POTEAQ6S8J7 498 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-205ENST00000432588 BRINP3Q76B58 766 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-205ENST00000432588 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-205ENST00000432588 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-205ENST00000432588 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ACTB-205ENST00000432588 MST1RQ04912 1400 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-205ENST00000432588 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-205ENST00000432588 SHPRHQ149N8 1683 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-205ENST00000432588 PTCH1Q13635 1447 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 LRP6O75581 1613 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 FOXD1Q16676 465 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 PPLO60437 1756 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-205ENST00000432588 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 RGL3Q3MIN7 710 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ACTB-205ENST00000432588 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-205ENST00000432588 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-205ENST00000432588 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-205ENST00000432588 ORAI2Q96SN7 254 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-205ENST00000432588 RXRBP28702 533 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-205ENST00000432588 AFF2P51816 1311 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-205ENST00000432588 LAMC1P11047 1609 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-205ENST00000432588 STK26Q9P289 416 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 C8orf37Q96NL8 207 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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