RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BCANQ96GW7 911 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMEM94Q12767 1356 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ITGAEP38570 1179 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 E9PCH4 1651 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NWD1Q149M9 1564 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PIK3R4Q99570 1358 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MSH6P52701 1360 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DIP2AQ14689 1571 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLAIN2Q9P270 581 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NAIPQ13075 1403 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRPM2O94759 1503 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HFM1A2PYH4 1435 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C14orf37Q86TY3 774 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATF3P18847 181 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRIM52Q96A61 297 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 JCADQ9P266 1359 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DCCP43146 1447 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTPRUQ92729 1446 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CLTCL1P53675 1640 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF1BO60333 1816 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 METP08581 1390 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PHLPP1O60346 1717 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BRINP3Q76B58 766 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POTEAQ6S8J7 498 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MST1RQ04912 1400 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTCH1Q13635 1447 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SHPRHQ149N8 1683 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPLO60437 1756 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FOXD1Q16676 465 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRP6O75581 1613 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RGL3Q3MIN7 710 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SIRT1Q96EB6 747 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCC11Q96J66 1382 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TECPR2O15040 1411 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LAMC1P11047 1609 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HRCP23327 699 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ORAI2Q96SN7 254 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PIK3C2GO75747 1445 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms