RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOM1O60784 492 aa24.28■■□□□ 1.48
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.28■■□□□ 1.48
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZFYVE9O95405 1425 aa24.26■■□□□ 1.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.24■■□□□ 1.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.23■■□□□ 1.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.22■■□□□ 1.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRPM2O94759 1503 aa24.21■■□□□ 1.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIP4K2BP78356 416 aa24.21■■□□□ 1.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNA6P17658 529 aa24.19■■□□□ 1.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLTCL1P53675 1640 aa24.16■■□□□ 1.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.14■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBX22Q9Y458 520 aa24.14■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF1BO60333 1816 aa24.13■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DIP2AQ14689 1571 aa24.12■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM94Q12767 1356 aa24.11■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NWD1Q149M9 1564 aa24.11■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.1■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXD1Q16676 465 aa24.08■■□□□ 1.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.07■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIK3R4Q99570 1358 aa24.06■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.06■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.04■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C14orf37Q86TY3 774 aa24.04■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.04■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MSH6P52701 1360 aa24.03■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSPA1LP34931 641 aa24.02■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.02■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.02■■□□□ 1.44
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALKQ9UM73 1620 aa23.99■■□□□ 1.43
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.98■■□□□ 1.43
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.97■■□□□ 1.43
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.97■■□□□ 1.43
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.95■■□□□ 1.42
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGL3Q3MIN7 710 aa23.94■■□□□ 1.42
CDH23-AS1-201ENST00000428918 METP08581 1390 aa23.91■■□□□ 1.42
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTPRUQ92729 1446 aa23.91■■□□□ 1.42
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPLO60437 1756 aa23.91■■□□□ 1.42
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATF3P18847 181 aa23.9■■□□□ 1.42
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.9■■□□□ 1.42
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.89■■□□□ 1.41
CDH23-AS1-201ENST00000428918 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.88■■□□□ 1.41
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLAIN2Q9P270 581 aa23.88■■□□□ 1.41
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.88■■□□□ 1.41
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.87■■□□□ 1.41
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HRCP23327 699 aa23.87■■□□□ 1.41
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.85■■□□□ 1.41
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.82■■□□□ 1.4
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IFT172Q9UG01 1749 aa23.79■■□□□ 1.4
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCCP43146 1447 aa23.79■■□□□ 1.4
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTCH1Q13635 1447 aa23.77■■□□□ 1.4
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.76■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIK3C2GO75747 1445 aa23.74■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHLPP1O60346 1717 aa23.73■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STK26Q9P289 416 aa23.72■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.72■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYOM2P54296 1465 aa23.71■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.71■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.7■■□□□ 1.39
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.68■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MST1RQ04912 1400 aa23.67■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LAMC1P11047 1609 aa23.67■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BRINP3Q76B58 766 aa23.66■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.65■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.65■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JCADQ9P266 1359 aa23.65■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.64■■□□□ 1.38
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.64■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TECPR2O15040 1411 aa23.63■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.63■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STAC3Q96MF2 364 aa23.63■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCC11Q96J66 1382 aa23.63■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ILDR2Q71H61 639 aa23.62■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.62■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.59■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.59■■□□□ 1.37
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.57■■□□□ 1.36
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms