RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.09■■□□□ 1.29
CITED1-204ENST00000427412 KCNA6P17658 529 aa23.09■■□□□ 1.29
CITED1-204ENST00000427412 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CITED1-204ENST00000427412 E9PCH4 1651 aa23.07■■□□□ 1.28
CITED1-204ENST00000427412 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.07■■□□□ 1.28
CITED1-204ENST00000427412 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.04■■□□□ 1.28
CITED1-204ENST00000427412 PHLPP1O60346 1717 aa23.04■■□□□ 1.28
CITED1-204ENST00000427412 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.03■■□□□ 1.28
CITED1-204ENST00000427412 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.03■■□□□ 1.28
CITED1-204ENST00000427412 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CITED1-204ENST00000427412 DIP2AQ14689 1571 aa23.02■■□□□ 1.28
CITED1-204ENST00000427412 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.99■■□□□ 1.27
CITED1-204ENST00000427412 MSH6P52701 1360 aa22.99■■□□□ 1.27
CITED1-204ENST00000427412 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CITED1-204ENST00000427412 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CITED1-204ENST00000427412 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CITED1-204ENST00000427412 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.94■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.93■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 ROCK1Q13464 1354 aa22.93■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.91■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 SHPRHQ149N8 1683 aa22.9■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 TRPM2O94759 1503 aa22.89■■□□□ 1.26
CITED1-204ENST00000427412 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.89■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 PIK3R4Q99570 1358 aa22.89■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 TBX22Q9Y458 520 aa22.88■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 JCADQ9P266 1359 aa22.88■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 BCANQ96GW7 911 aa22.87■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 SLAIN2Q9P270 581 aa22.87■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 POTEAQ6S8J7 498 aa22.86■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.84■■□□□ 1.25
CITED1-204ENST00000427412 LRP6O75581 1613 aa22.82■■□□□ 1.24
CITED1-204ENST00000427412 DCCP43146 1447 aa22.79■■□□□ 1.24
CITED1-204ENST00000427412 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.79■■□□□ 1.24
CITED1-204ENST00000427412 PTPRUQ92729 1446 aa22.78■■□□□ 1.24
CITED1-204ENST00000427412 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CITED1-204ENST00000427412 NUP155O75694 1391 aa22.76■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.76■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.75■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 CLTCL1P53675 1640 aa22.74■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 KIF1BO60333 1816 aa22.73■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.73■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.72■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.72■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 C14orf37Q86TY3 774 aa22.71■■□□□ 1.23
CITED1-204ENST00000427412 ATF3P18847 181 aa22.69■■□□□ 1.22
CITED1-204ENST00000427412 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.69■■□□□ 1.22
CITED1-204ENST00000427412 MST1RQ04912 1400 aa22.68■■□□□ 1.22
CITED1-204ENST00000427412 BRINP3Q76B58 766 aa22.66■■□□□ 1.22
CITED1-204ENST00000427412 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.65■■□□□ 1.22
CITED1-204ENST00000427412 LAMC1P11047 1609 aa22.65■■□□□ 1.22
CITED1-204ENST00000427412 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.65■■□□□ 1.22
CITED1-204ENST00000427412 METP08581 1390 aa22.63■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 ITGAEP38570 1179 aa22.6■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.59■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 PPLO60437 1756 aa22.58■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 PTCH1Q13635 1447 aa22.58■■□□□ 1.21
CITED1-204ENST00000427412 NAIPQ13075 1403 aa22.57■■□□□ 1.2
CITED1-204ENST00000427412 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CITED1-204ENST00000427412 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.52■■□□□ 1.2
CITED1-204ENST00000427412 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.51■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 TRIM52Q96A61 297 aa22.49■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 AFF2P51816 1311 aa22.49■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 RXRBP28702 533 aa22.48■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 HFM1A2PYH4 1435 aa22.48■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 IFT172Q9UG01 1749 aa22.47■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 RGS12O14924 1447 aa22.46■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.46■■□□□ 1.19
CITED1-204ENST00000427412 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.45■■□□□ 1.18
CITED1-204ENST00000427412 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CITED1-204ENST00000427412 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.43■■□□□ 1.18
CITED1-204ENST00000427412 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CITED1-204ENST00000427412 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CITED1-204ENST00000427412 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.4■■□□□ 1.18
CITED1-204ENST00000427412 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CITED1-204ENST00000427412 C8orf37Q96NL8 207 aa22.38■■□□□ 1.17
CITED1-204ENST00000427412 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CITED1-204ENST00000427412 MYOM2P54296 1465 aa22.34■■□□□ 1.17
CITED1-204ENST00000427412 PXDNQ92626 1479 aa22.34■■□□□ 1.17
CITED1-204ENST00000427412 TECPR2O15040 1411 aa22.34■■□□□ 1.17
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