RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 NWD1Q149M9 1564 aa31.85■■■□□ 2.69
UBXN4-204ENST00000426921 NUP155O75694 1391 aa31.85■■■□□ 2.69
UBXN4-204ENST00000426921 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.83■■■□□ 2.69
UBXN4-204ENST00000426921 KCNA6P17658 529 aa31.83■■■□□ 2.69
UBXN4-204ENST00000426921 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.83■■■□□ 2.69
UBXN4-204ENST00000426921 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.82■■■□□ 2.68
UBXN4-204ENST00000426921 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM94Q12767 1356 aa31.78■■■□□ 2.68
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UBXN4-204ENST00000426921 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
UBXN4-204ENST00000426921 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
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UBXN4-204ENST00000426921 DIP2AQ14689 1571 aa31.69■■■□□ 2.66
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UBXN4-204ENST00000426921 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.67■■■□□ 2.66
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.67■■■□□ 2.66
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UBXN4-204ENST00000426921 TBX22Q9Y458 520 aa31.67■■■□□ 2.66
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UBXN4-204ENST00000426921 HFM1A2PYH4 1435 aa31.62■■■□□ 2.65
UBXN4-204ENST00000426921 PIK3R4Q99570 1358 aa31.61■■■□□ 2.65
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UBXN4-204ENST00000426921 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
UBXN4-204ENST00000426921 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.58■■■□□ 2.65
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UBXN4-204ENST00000426921 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.55■■■□□ 2.64
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UBXN4-204ENST00000426921 KIF1BO60333 1816 aa31.42■■■□□ 2.62
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
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UBXN4-204ENST00000426921 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
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UBXN4-204ENST00000426921 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.38■■■□□ 2.61
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UBXN4-204ENST00000426921 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.36■■■□□ 2.61
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UBXN4-204ENST00000426921 C14orf37Q86TY3 774 aa31.35■■■□□ 2.61
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UBXN4-204ENST00000426921 PHLPP1O60346 1717 aa31.35■■■□□ 2.61
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UBXN4-204ENST00000426921 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
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UBXN4-204ENST00000426921 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.23■■■□□ 2.59
UBXN4-204ENST00000426921 PTCH1Q13635 1447 aa31.22■■■□□ 2.59
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UBXN4-204ENST00000426921 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.15■■■□□ 2.58
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UBXN4-204ENST00000426921 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.96■■■□□ 2.55
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UBXN4-204ENST00000426921 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
UBXN4-204ENST00000426921 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.91■■■□□ 2.54
UBXN4-204ENST00000426921 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
UBXN4-204ENST00000426921 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
UBXN4-204ENST00000426921 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.9■■■□□ 2.54
UBXN4-204ENST00000426921 ABCC11Q96J66 1382 aa30.9■■■□□ 2.54
UBXN4-204ENST00000426921 MYOM2P54296 1465 aa30.89■■■□□ 2.54
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
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