RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GGT6Q6P531 493 aa25.36■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PANK3Q9H999 370 aa25.36■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.34■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLRP13Q86W25 1043 aa25.34■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.34■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLI2P10070 1586 aa25.33■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.33■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYNMO15061 1565 aa25.31■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.3■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.3■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.29■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.29■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.29■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDCA8Q53HL2 280 aa25.29■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPLO60437 1756 aa25.29■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOS1P29475 1434 aa25.27■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYOM1P52179 1685 aa25.27■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.27■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.27■■□□□ 1.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.25■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.24■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.23■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.23■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIK3C2BO00750 1634 aa25.23■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDCQ9Y266 331 aa25.22■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIK3C2GO75747 1445 aa25.21■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIP2BQ9P265 1576 aa25.2■■□□□ 1.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK-7P63135 1459 aa25.19■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.19■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC24A1O60721 1099 aa25.19■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.18■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.18■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.17■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.17■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.16■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.16■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRB1O14514 1584 aa25.14■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INSRP06213 1382 aa25.14■■□□□ 1.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.13■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.11■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.11■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.1■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPOAP1O95153 1857 aa25.09■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.09■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.08■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.08■■□□□ 1.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP2R1AP30153 589 aa25.07■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.05■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IDI1Q13907 227 aa25.03■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.03■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.02■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REREQ9P2R6 1566 aa25.02■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.02■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE3BQ13370 1112 aa25.01■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFYVE9O95405 1425 aa24.99■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.97■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGLP35573 1532 aa24.97■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.97■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.95■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYT1Q01538 1121 aa24.93■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.9■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.88■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.88■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP32Q8NFA0 1604 aa24.86■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.86■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.85■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EVC2Q86UK5 1308 aa24.85■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.82■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.82■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPRMP28827 1452 aa24.8■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALKQ9UM73 1620 aa24.78■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF521Q96K83 1311 aa24.78■■□□□ 1.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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