RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421510.5

EHD1-204, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene EHD1, Length 1,015 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-204ENST00000421510 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.07■■■□□ 2.57
EHD1-204ENST00000421510 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
EHD1-204ENST00000421510 ILDR2Q71H61 639 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD1-204ENST00000421510 KCNA6P17658 529 aa31.04■■■□□ 2.56
EHD1-204ENST00000421510 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
EHD1-204ENST00000421510 BCANQ96GW7 911 aa31.03■■■□□ 2.56
EHD1-204ENST00000421510 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.03■■■□□ 2.56
EHD1-204ENST00000421510 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
EHD1-204ENST00000421510 NWD1Q149M9 1564 aa31.01■■■□□ 2.56
EHD1-204ENST00000421510 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
EHD1-204ENST00000421510 TMEM94Q12767 1356 aa31■■■□□ 2.55
EHD1-204ENST00000421510 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
EHD1-204ENST00000421510 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
EHD1-204ENST00000421510 NAIPQ13075 1403 aa30.96■■■□□ 2.55
EHD1-204ENST00000421510 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
EHD1-204ENST00000421510 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
EHD1-204ENST00000421510 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.93■■■□□ 2.54
EHD1-204ENST00000421510 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
EHD1-204ENST00000421510 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
EHD1-204ENST00000421510 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
EHD1-204ENST00000421510 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.89■■■□□ 2.53
EHD1-204ENST00000421510 TBX22Q9Y458 520 aa30.88■■■□□ 2.53
EHD1-204ENST00000421510 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
EHD1-204ENST00000421510 DIP2AQ14689 1571 aa30.87■■■□□ 2.53
EHD1-204ENST00000421510 HFM1A2PYH4 1435 aa30.86■■■□□ 2.53
EHD1-204ENST00000421510 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.83■■■□□ 2.53
EHD1-204ENST00000421510 TRPM2O94759 1503 aa30.82■■■□□ 2.52
EHD1-204ENST00000421510 MSH6P52701 1360 aa30.81■■■□□ 2.52
EHD1-204ENST00000421510 CLTCL1P53675 1640 aa30.8■■■□□ 2.52
EHD1-204ENST00000421510 SOCS7O14512 581 aa30.8■■■□□ 2.52
EHD1-204ENST00000421510 PIK3R4Q99570 1358 aa30.79■■■□□ 2.52
EHD1-204ENST00000421510 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.77■■■□□ 2.52
EHD1-204ENST00000421510 TRIM52Q96A61 297 aa30.76■■■□□ 2.51
EHD1-204ENST00000421510 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
EHD1-204ENST00000421510 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.74■■■□□ 2.51
EHD1-204ENST00000421510 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.73■■■□□ 2.51
EHD1-204ENST00000421510 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.72■■■□□ 2.51
EHD1-204ENST00000421510 PTPRUQ92729 1446 aa30.71■■■□□ 2.51
EHD1-204ENST00000421510 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.7■■■□□ 2.51
EHD1-204ENST00000421510 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
EHD1-204ENST00000421510 SLAIN2Q9P270 581 aa30.68■■■□□ 2.5
EHD1-204ENST00000421510 C14orf37Q86TY3 774 aa30.67■■■□□ 2.5
EHD1-204ENST00000421510 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
EHD1-204ENST00000421510 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.67■■■□□ 2.5
EHD1-204ENST00000421510 KIF1BO60333 1816 aa30.67■■■□□ 2.5
EHD1-204ENST00000421510 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
EHD1-204ENST00000421510 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
EHD1-204ENST00000421510 METP08581 1390 aa30.6■■■□□ 2.49
EHD1-204ENST00000421510 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.59■■■□□ 2.49
EHD1-204ENST00000421510 PHLPP1O60346 1717 aa30.57■■■□□ 2.48
EHD1-204ENST00000421510 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.57■■■□□ 2.48
EHD1-204ENST00000421510 ATF3P18847 181 aa30.56■■■□□ 2.48
EHD1-204ENST00000421510 FOXD1Q16676 465 aa30.53■■■□□ 2.48
EHD1-204ENST00000421510 DCCP43146 1447 aa30.51■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.49■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 PPLO60437 1756 aa30.47■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 JCADQ9P266 1359 aa30.47■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.46■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.46■■■□□ 2.47
EHD1-204ENST00000421510 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.45■■■□□ 2.46
EHD1-204ENST00000421510 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.42■■■□□ 2.46
EHD1-204ENST00000421510 MST1RQ04912 1400 aa30.42■■■□□ 2.46
EHD1-204ENST00000421510 BRINP3Q76B58 766 aa30.42■■■□□ 2.46
EHD1-204ENST00000421510 PTCH1Q13635 1447 aa30.41■■■□□ 2.46
EHD1-204ENST00000421510 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.39■■■□□ 2.46
EHD1-204ENST00000421510 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.39■■■□□ 2.45
EHD1-204ENST00000421510 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.39■■■□□ 2.45
EHD1-204ENST00000421510 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.37■■■□□ 2.45
EHD1-204ENST00000421510 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.37■■■□□ 2.45
EHD1-204ENST00000421510 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
EHD1-204ENST00000421510 RGL3Q3MIN7 710 aa30.33■■■□□ 2.45
EHD1-204ENST00000421510 SHPRHQ149N8 1683 aa30.33■■■□□ 2.45
EHD1-204ENST00000421510 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.32■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 IFT172Q9UG01 1749 aa30.32■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 LRP6O75581 1613 aa30.32■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.31■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.31■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.3■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 POTEAQ6S8J7 498 aa30.3■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.28■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.26■■■□□ 2.44
EHD1-204ENST00000421510 PIK3C2GO75747 1445 aa30.22■■■□□ 2.43
EHD1-204ENST00000421510 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
EHD1-204ENST00000421510 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
EHD1-204ENST00000421510 TECPR2O15040 1411 aa30.19■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.17■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 STK26Q9P289 416 aa30.17■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 LAMC1P11047 1609 aa30.15■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 ORAI2Q96SN7 254 aa30.15■■■□□ 2.42
EHD1-204ENST00000421510 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms