RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.49■■□□□ 1.83
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PTPRJ-201ENST00000418331 KIF16BQ96L93 1317 aa26.48■■□□□ 1.83
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PTPRJ-201ENST00000418331 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.47■■□□□ 1.83
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PTPRJ-201ENST00000418331 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.28■■□□□ 1.8
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PTPRJ-201ENST00000418331 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.27■■□□□ 1.8
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PTPRJ-201ENST00000418331 HECW1Q76N89 1606 aa26.26■■□□□ 1.79
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PTPRJ-201ENST00000418331 PRAM1Q96QH2 718 aa26.25■■□□□ 1.79
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PTPRJ-201ENST00000418331 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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PTPRJ-201ENST00000418331 PRKAR2BP31323 418 aa26.19■■□□□ 1.78
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PTPRJ-201ENST00000418331 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 GSE1Q14687 1217 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.16■■□□□ 1.78
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