RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.26□□□□□ -0.13
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CD27-AS1-202ENST00000417058 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.24□□□□□ -0.13
CD27-AS1-202ENST00000417058 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.24□□□□□ -0.13
CD27-AS1-202ENST00000417058 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
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CD27-AS1-202ENST00000417058 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.23□□□□□ -0.13
CD27-AS1-202ENST00000417058 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
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CD27-AS1-202ENST00000417058 IFT172Q9UG01 1749 aa14.22□□□□□ -0.13
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CD27-AS1-202ENST00000417058 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.17□□□□□ -0.14
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CD27-AS1-202ENST00000417058 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CD27-AS1-202ENST00000417058 LTKP29376 864 aa14.12□□□□□ -0.15
CD27-AS1-202ENST00000417058 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.11□□□□□ -0.15
CD27-AS1-202ENST00000417058 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.11□□□□□ -0.15
CD27-AS1-202ENST00000417058 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.11□□□□□ -0.15
CD27-AS1-202ENST00000417058 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.11□□□□□ -0.15
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CD27-AS1-202ENST00000417058 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.09□□□□□ -0.15
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CD27-AS1-202ENST00000417058 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.08□□□□□ -0.16
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CD27-AS1-202ENST00000417058 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.03□□□□□ -0.16
CD27-AS1-202ENST00000417058 DIP2AQ14689 1571 aa14.02□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.02□□□□□ -0.17
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CD27-AS1-202ENST00000417058 TBX22Q9Y458 520 aa14.01□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 METP08581 1390 aa13.99□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.99□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 BCANQ96GW7 911 aa13.99□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.99□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 STRCQ7RTU9 1775 aa13.99□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 USP47Q96K76 1375 aa13.98□□□□□ -0.17
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CD27-AS1-202ENST00000417058 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 PIK3R4Q99570 1358 aa13.96□□□□□ -0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 ABCC11Q96J66 1382 aa13.95□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 TECPR2O15040 1411 aa13.94□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 PTPRUQ92729 1446 aa13.94□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.93□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 DLC1Q96QB1 1528 aa13.93□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.93□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.93□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 STK26Q9P289 416 aa13.93□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 CPS1P31327 1500 aa13.92□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 SIRT1Q96EB6 747 aa13.92□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.91□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 TESK2Q96S53 571 aa13.9□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 PTCH1Q13635 1447 aa13.9□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.9□□□□□ -0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 KCNA6P17658 529 aa13.89□□□□□ -0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.89□□□□□ -0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 NWD1Q149M9 1564 aa13.89□□□□□ -0.19
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