RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402613.3

VSTM2A-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VSTM2A, Length 1,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-202ENST00000402613 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.65■■■■□ 3.3
VSTM2A-202ENST00000402613 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.64■■■■□ 3.3
VSTM2A-202ENST00000402613 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.63■■■■□ 3.29
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
VSTM2A-202ENST00000402613 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.63■■■■□ 3.29
VSTM2A-202ENST00000402613 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.61■■■■□ 3.29
VSTM2A-202ENST00000402613 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
VSTM2A-202ENST00000402613 TOM1O60784 492 aa35.59■■■■□ 3.29
VSTM2A-202ENST00000402613 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
VSTM2A-202ENST00000402613 KCNA6P17658 529 aa35.57■■■■□ 3.28
VSTM2A-202ENST00000402613 TRPM2O94759 1503 aa35.55■■■■□ 3.28
VSTM2A-202ENST00000402613 TBX22Q9Y458 520 aa35.51■■■■□ 3.28
VSTM2A-202ENST00000402613 PIP4K2BP78356 416 aa35.5■■■■□ 3.27
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
VSTM2A-202ENST00000402613 CLTCL1P53675 1640 aa35.49■■■■□ 3.27
VSTM2A-202ENST00000402613 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.48■■■■□ 3.27
VSTM2A-202ENST00000402613 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
VSTM2A-202ENST00000402613 FOXD1Q16676 465 aa35.46■■■■□ 3.27
VSTM2A-202ENST00000402613 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.46■■■■□ 3.27
VSTM2A-202ENST00000402613 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.45■■■■□ 3.27
VSTM2A-202ENST00000402613 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
VSTM2A-202ENST00000402613 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
VSTM2A-202ENST00000402613 TMEM94Q12767 1356 aa35.42■■■■□ 3.26
VSTM2A-202ENST00000402613 ALKQ9UM73 1620 aa35.42■■■■□ 3.26
VSTM2A-202ENST00000402613 NWD1Q149M9 1564 aa35.4■■■■□ 3.26
VSTM2A-202ENST00000402613 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
VSTM2A-202ENST00000402613 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
VSTM2A-202ENST00000402613 DIP2AQ14689 1571 aa35.35■■■■□ 3.25
VSTM2A-202ENST00000402613 PIK3R4Q99570 1358 aa35.35■■■■□ 3.25
VSTM2A-202ENST00000402613 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.35■■■■□ 3.25
VSTM2A-202ENST00000402613 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
VSTM2A-202ENST00000402613 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.33■■■■□ 3.25
VSTM2A-202ENST00000402613 HSPA1LP34931 641 aa35.33■■■■□ 3.25
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF1BO60333 1816 aa35.32■■■■□ 3.24
VSTM2A-202ENST00000402613 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
VSTM2A-202ENST00000402613 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.3■■■■□ 3.24
VSTM2A-202ENST00000402613 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.29■■■■□ 3.24
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.27■■■■□ 3.24
VSTM2A-202ENST00000402613 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
VSTM2A-202ENST00000402613 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.26■■■■□ 3.24
VSTM2A-202ENST00000402613 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.26■■■■□ 3.24
VSTM2A-202ENST00000402613 PTPRUQ92729 1446 aa35.24■■■■□ 3.23
VSTM2A-202ENST00000402613 MSH6P52701 1360 aa35.22■■■■□ 3.23
VSTM2A-202ENST00000402613 METP08581 1390 aa35.21■■■■□ 3.23
VSTM2A-202ENST00000402613 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.2■■■■□ 3.23
VSTM2A-202ENST00000402613 HRCP23327 699 aa35.18■■■■□ 3.22
VSTM2A-202ENST00000402613 RGL3Q3MIN7 710 aa35.17■■■■□ 3.22
VSTM2A-202ENST00000402613 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.16■■■■□ 3.22
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.15■■■■□ 3.22
VSTM2A-202ENST00000402613 C14orf37Q86TY3 774 aa35.14■■■■□ 3.22
VSTM2A-202ENST00000402613 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.11■■■■□ 3.21
VSTM2A-202ENST00000402613 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.1■■■■□ 3.21
VSTM2A-202ENST00000402613 SLAIN2Q9P270 581 aa35.1■■■■□ 3.21
VSTM2A-202ENST00000402613 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
VSTM2A-202ENST00000402613 PPLO60437 1756 aa35.08■■■■□ 3.21
VSTM2A-202ENST00000402613 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.06■■■■□ 3.2
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.06■■■■□ 3.2
VSTM2A-202ENST00000402613 ATF3P18847 181 aa35.03■■■■□ 3.2
VSTM2A-202ENST00000402613 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.03■■■■□ 3.2
VSTM2A-202ENST00000402613 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.98■■■■□ 3.19
VSTM2A-202ENST00000402613 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
VSTM2A-202ENST00000402613 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
VSTM2A-202ENST00000402613 DCCP43146 1447 aa34.93■■■■□ 3.18
VSTM2A-202ENST00000402613 IFT172Q9UG01 1749 aa34.92■■■■□ 3.18
VSTM2A-202ENST00000402613 PTCH1Q13635 1447 aa34.92■■■■□ 3.18
VSTM2A-202ENST00000402613 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.92■■■■□ 3.18
VSTM2A-202ENST00000402613 PIK3C2GO75747 1445 aa34.9■■■■□ 3.18
VSTM2A-202ENST00000402613 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.9■■■■□ 3.18
VSTM2A-202ENST00000402613 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.89■■■■□ 3.18
VSTM2A-202ENST00000402613 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
VSTM2A-202ENST00000402613 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.83■■■■□ 3.17
VSTM2A-202ENST00000402613 ILDR2Q71H61 639 aa34.83■■■■□ 3.17
VSTM2A-202ENST00000402613 MYOM2P54296 1465 aa34.83■■■■□ 3.17
VSTM2A-202ENST00000402613 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.83■■■■□ 3.17
VSTM2A-202ENST00000402613 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 STK26Q9P289 416 aa34.82■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 MST1RQ04912 1400 aa34.81■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 BRINP3Q76B58 766 aa34.81■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.78■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCC11Q96J66 1382 aa34.77■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.77■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.77■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 TECPR2O15040 1411 aa34.77■■■■□ 3.16
VSTM2A-202ENST00000402613 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.74■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 PHLPP1O60346 1717 aa34.74■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.73■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.73■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 STAC3Q96MF2 364 aa34.7■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 JCADQ9P266 1359 aa34.7■■■■□ 3.15
VSTM2A-202ENST00000402613 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
VSTM2A-202ENST00000402613 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.68■■■■□ 3.14
VSTM2A-202ENST00000402613 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
VSTM2A-202ENST00000402613 SIRT1Q96EB6 747 aa34.66■■■■□ 3.14
VSTM2A-202ENST00000402613 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.65■■■■□ 3.14
VSTM2A-202ENST00000402613 LAMC1P11047 1609 aa34.64■■■■□ 3.14
VSTM2A-202ENST00000402613 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.62■■■■□ 3.13
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