RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399208.6

SETD4-205, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD4, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-205ENST00000399208 POTEAQ6S8J7 498 aa22.93■■□□□ 1.26
SETD4-205ENST00000399208 MSH6P52701 1360 aa22.92■■□□□ 1.26
SETD4-205ENST00000399208 ADGRL2O95490 1459 aa22.91■■□□□ 1.26
SETD4-205ENST00000399208 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SETD4-205ENST00000399208 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SETD4-205ENST00000399208 SLAIN2Q9P270 581 aa22.9■■□□□ 1.26
SETD4-205ENST00000399208 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.88■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 ZFYVE9O95405 1425 aa22.87■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.86■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 PHLPP1O60346 1717 aa22.85■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 JCADQ9P266 1359 aa22.85■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.85■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.84■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 TBX22Q9Y458 520 aa22.83■■□□□ 1.25
SETD4-205ENST00000399208 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.83■■□□□ 1.24
SETD4-205ENST00000399208 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.82■■□□□ 1.24
SETD4-205ENST00000399208 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.82■■□□□ 1.24
SETD4-205ENST00000399208 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
SETD4-205ENST00000399208 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SETD4-205ENST00000399208 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 C14orf37Q86TY3 774 aa22.76■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.74■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.74■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 UNC13BO14795 1591 aa22.74■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.74■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 DIP2AQ14689 1571 aa22.73■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 PIK3R4Q99570 1358 aa22.73■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.73■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 ATF3P18847 181 aa22.72■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 E9PCH4 1651 aa22.71■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SETD4-205ENST00000399208 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 LRP6O75581 1613 aa22.68■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 SHPRHQ149N8 1683 aa22.66■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.66■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.66■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 TRPM2O94759 1503 aa22.66■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 ROCK1Q13464 1354 aa22.65■■□□□ 1.22
SETD4-205ENST00000399208 BRINP3Q76B58 766 aa22.62■■□□□ 1.21
SETD4-205ENST00000399208 PTPRUQ92729 1446 aa22.62■■□□□ 1.21
SETD4-205ENST00000399208 NUP155O75694 1391 aa22.62■■□□□ 1.21
SETD4-205ENST00000399208 TRIM52Q96A61 297 aa22.6■■□□□ 1.21
SETD4-205ENST00000399208 DCCP43146 1447 aa22.59■■□□□ 1.21
SETD4-205ENST00000399208 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
SETD4-205ENST00000399208 RXRBP28702 533 aa22.57■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.55■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.54■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.54■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.53■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 MST1RQ04912 1400 aa22.52■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SETD4-205ENST00000399208 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.51■■□□□ 1.19
SETD4-205ENST00000399208 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SETD4-205ENST00000399208 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SETD4-205ENST00000399208 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.51■■□□□ 1.19
SETD4-205ENST00000399208 ITGAEP38570 1179 aa22.5■■□□□ 1.19
SETD4-205ENST00000399208 AFF2P51816 1311 aa22.5■■□□□ 1.19
SETD4-205ENST00000399208 METP08581 1390 aa22.49■■□□□ 1.19
SETD4-205ENST00000399208 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.46■■□□□ 1.19
SETD4-205ENST00000399208 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SETD4-205ENST00000399208 C8orf37Q96NL8 207 aa22.42■■□□□ 1.18
SETD4-205ENST00000399208 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SETD4-205ENST00000399208 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.41■■□□□ 1.18
SETD4-205ENST00000399208 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.41■■□□□ 1.18
SETD4-205ENST00000399208 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.41■■□□□ 1.18
SETD4-205ENST00000399208 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SETD4-205ENST00000399208 CLTCL1P53675 1640 aa22.39■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.37■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 KIF1BO60333 1816 aa22.37■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 RGS12O14924 1447 aa22.37■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 NGLY1Q96IV0 654 aa22.36■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 LAMC1P11047 1609 aa22.35■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 ADAMTS2O95450 1211 aa22.34■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 PTCH1Q13635 1447 aa22.33■■□□□ 1.17
SETD4-205ENST00000399208 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SETD4-205ENST00000399208 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SETD4-205ENST00000399208 ORAI2Q96SN7 254 aa22.31■■□□□ 1.16
SETD4-205ENST00000399208 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.3■■□□□ 1.16
SETD4-205ENST00000399208 USP21Q9UK80 565 aa22.28■■□□□ 1.16
SETD4-205ENST00000399208 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.28■■□□□ 1.16
SETD4-205ENST00000399208 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.27■■□□□ 1.16
SETD4-205ENST00000399208 NAIPQ13075 1403 aa22.26■■□□□ 1.15
SETD4-205ENST00000399208 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SETD4-205ENST00000399208 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SETD4-205ENST00000399208 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.25■■□□□ 1.15
SETD4-205ENST00000399208 HFM1A2PYH4 1435 aa22.25■■□□□ 1.15
SETD4-205ENST00000399208 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SETD4-205ENST00000399208 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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