RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.18■■■□□ 2.42
CLDN3-201ENST00000395145 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.13■■■□□ 2.41
CLDN3-201ENST00000395145 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.41
CLDN3-201ENST00000395145 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.11■■■□□ 2.41
CLDN3-201ENST00000395145 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.08■■■□□ 2.41
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CLDN3-201ENST00000395145 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.06■■■□□ 2.4
CLDN3-201ENST00000395145 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.05■■■□□ 2.4
CLDN3-201ENST00000395145 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CLDN3-201ENST00000395145 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.02■■■□□ 2.4
CLDN3-201ENST00000395145 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.99■■■□□ 2.39
CLDN3-201ENST00000395145 PPLO60437 1756 aa29.98■■■□□ 2.39
CLDN3-201ENST00000395145 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CLDN3-201ENST00000395145 CERKQ8TCT0 537 aa29.98■■■□□ 2.39
CLDN3-201ENST00000395145 CPS1P31327 1500 aa29.96■■■□□ 2.39
CLDN3-201ENST00000395145 DIP2AQ14689 1571 aa29.96■■■□□ 2.39
CLDN3-201ENST00000395145 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.95■■■□□ 2.39
CLDN3-201ENST00000395145 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.95■■■□□ 2.39
CLDN3-201ENST00000395145 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.95■■■□□ 2.38
CLDN3-201ENST00000395145 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.94■■■□□ 2.38
CLDN3-201ENST00000395145 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.93■■■□□ 2.38
CLDN3-201ENST00000395145 BCANQ96GW7 911 aa29.93■■■□□ 2.38
CLDN3-201ENST00000395145 IFT172Q9UG01 1749 aa29.93■■■□□ 2.38
CLDN3-201ENST00000395145 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.93■■■□□ 2.38
CLDN3-201ENST00000395145 TBX22Q9Y458 520 aa29.91■■■□□ 2.38
CLDN3-201ENST00000395145 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CLDN3-201ENST00000395145 RGL3Q3MIN7 710 aa29.88■■■□□ 2.37
CLDN3-201ENST00000395145 NWD1Q149M9 1564 aa29.88■■■□□ 2.37
CLDN3-201ENST00000395145 FBXO41Q8TF61 875 aa29.87■■■□□ 2.37
CLDN3-201ENST00000395145 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CLDN3-201ENST00000395145 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CLDN3-201ENST00000395145 KCNA6P17658 529 aa29.85■■■□□ 2.37
CLDN3-201ENST00000395145 PIK3R4Q99570 1358 aa29.85■■■□□ 2.37
CLDN3-201ENST00000395145 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CLDN3-201ENST00000395145 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.82■■■□□ 2.36
CLDN3-201ENST00000395145 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CLDN3-201ENST00000395145 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CLDN3-201ENST00000395145 MYOM2P54296 1465 aa29.79■■■□□ 2.36
CLDN3-201ENST00000395145 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.77■■■□□ 2.36
CLDN3-201ENST00000395145 ALKQ9UM73 1620 aa29.77■■■□□ 2.36
CLDN3-201ENST00000395145 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.75■■■□□ 2.35
CLDN3-201ENST00000395145 PIK3C2GO75747 1445 aa29.74■■■□□ 2.35
CLDN3-201ENST00000395145 PTPRUQ92729 1446 aa29.74■■■□□ 2.35
CLDN3-201ENST00000395145 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CLDN3-201ENST00000395145 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.74■■■□□ 2.35
CLDN3-201ENST00000395145 METP08581 1390 aa29.74■■■□□ 2.35
CLDN3-201ENST00000395145 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CLDN3-201ENST00000395145 STAC3Q96MF2 364 aa29.7■■■□□ 2.35
CLDN3-201ENST00000395145 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.68■■■□□ 2.34
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM94Q12767 1356 aa29.67■■■□□ 2.34
CLDN3-201ENST00000395145 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CLDN3-201ENST00000395145 LAMC1P11047 1609 aa29.65■■■□□ 2.34
CLDN3-201ENST00000395145 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.64■■■□□ 2.34
CLDN3-201ENST00000395145 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.63■■■□□ 2.33
CLDN3-201ENST00000395145 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.63■■■□□ 2.33
CLDN3-201ENST00000395145 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.61■■■□□ 2.33
CLDN3-201ENST00000395145 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.61■■■□□ 2.33
CLDN3-201ENST00000395145 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CLDN3-201ENST00000395145 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.58■■■□□ 2.33
CLDN3-201ENST00000395145 PTCH1Q13635 1447 aa29.58■■■□□ 2.33
CLDN3-201ENST00000395145 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.58■■■□□ 2.33
CLDN3-201ENST00000395145 TOM1O60784 492 aa29.56■■■□□ 2.32
CLDN3-201ENST00000395145 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CLDN3-201ENST00000395145 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.54■■■□□ 2.32
CLDN3-201ENST00000395145 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.54■■■□□ 2.32
CLDN3-201ENST00000395145 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CLDN3-201ENST00000395145 NEUROD1Q13562 356 aa29.53■■■□□ 2.32
CLDN3-201ENST00000395145 TECPR2O15040 1411 aa29.53■■■□□ 2.32
CLDN3-201ENST00000395145 MSH6P52701 1360 aa29.52■■■□□ 2.32
CLDN3-201ENST00000395145 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.51■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.5■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.5■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 ADGRB1O14514 1584 aa29.5■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 ABCC11Q96J66 1382 aa29.5■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.48■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.46■■■□□ 2.31
CLDN3-201ENST00000395145 DCCP43146 1447 aa29.45■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.45■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 C14orf37Q86TY3 774 aa29.44■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.44■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 STK26Q9P289 416 aa29.43■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.43■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.41■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 SIRT1Q96EB6 747 aa29.41■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 DLC1Q96QB1 1528 aa29.4■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 PIP4K2BP78356 416 aa29.4■■■□□ 2.3
CLDN3-201ENST00000395145 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.38■■■□□ 2.29
CLDN3-201ENST00000395145 TONSLQ96HA7 1378 aa29.38■■■□□ 2.29
CLDN3-201ENST00000395145 ATF3P18847 181 aa29.36■■■□□ 2.29
CLDN3-201ENST00000395145 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CLDN3-201ENST00000395145 SLAIN2Q9P270 581 aa29.34■■■□□ 2.29
CLDN3-201ENST00000395145 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.33■■■□□ 2.29
CLDN3-201ENST00000395145 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.33■■■□□ 2.29
CLDN3-201ENST00000395145 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.33■■■□□ 2.29
CLDN3-201ENST00000395145 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.31■■■□□ 2.28
CLDN3-201ENST00000395145 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms