RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 ZFYVE9O95405 1425 aa40.69■■■■■ 4.1
GIPC1-202ENST00000393028 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.69■■■■■ 4.1
GIPC1-202ENST00000393028 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.68■■■■■ 4.1
GIPC1-202ENST00000393028 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
GIPC1-202ENST00000393028 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.65■■■■■ 4.1
GIPC1-202ENST00000393028 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.64■■■■■ 4.1
GIPC1-202ENST00000393028 MYOM2P54296 1465 aa40.63■■■■■ 4.09
GIPC1-202ENST00000393028 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.62■■■■■ 4.09
GIPC1-202ENST00000393028 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
GIPC1-202ENST00000393028 HSPA2P54652 639 aa40.58■■■■■ 4.09
GIPC1-202ENST00000393028 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.55■■■■■ 4.08
GIPC1-202ENST00000393028 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
GIPC1-202ENST00000393028 LTKP29376 864 aa40.54■■■■■ 4.08
GIPC1-202ENST00000393028 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
GIPC1-202ENST00000393028 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
GIPC1-202ENST00000393028 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.52■■■■■ 4.08
GIPC1-202ENST00000393028 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.51■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 IQGAP1P46940 1657 aa40.51■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.5■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 EID1Q9Y6B2 187 aa40.49■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.47■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 PIK3C2GO75747 1445 aa40.46■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 NBPF8Q3BBV2 869 aa40.45■■■■■ 4.07
GIPC1-202ENST00000393028 STRCQ7RTU9 1775 aa40.44■■■■■ 4.06
GIPC1-202ENST00000393028 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.44■■■■■ 4.06
GIPC1-202ENST00000393028 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.43■■■■■ 4.06
GIPC1-202ENST00000393028 STAC3Q96MF2 364 aa40.43■■■■■ 4.06
GIPC1-202ENST00000393028 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.42■■■■■ 4.06
GIPC1-202ENST00000393028 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.41■■■■■ 4.06
GIPC1-202ENST00000393028 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.41■■■■■ 4.06
GIPC1-202ENST00000393028 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
GIPC1-202ENST00000393028 LAMC1P11047 1609 aa40.37■■■■■ 4.05
GIPC1-202ENST00000393028 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.37■■■■■ 4.05
GIPC1-202ENST00000393028 ALKQ9UM73 1620 aa40.35■■■■■ 4.05
GIPC1-202ENST00000393028 BCANQ96GW7 911 aa40.34■■■■■ 4.05
GIPC1-202ENST00000393028 MED14O60244 1454 aa40.33■■■■■ 4.05
GIPC1-202ENST00000393028 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
GIPC1-202ENST00000393028 RALGAPBQ86X10 1494 aa40.31■■■■■ 4.04
GIPC1-202ENST00000393028 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.3■■■■■ 4.04
GIPC1-202ENST00000393028 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.3■■■■■ 4.04
GIPC1-202ENST00000393028 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.28■■■■■ 4.04
GIPC1-202ENST00000393028 DIP2AQ14689 1571 aa40.26■■■■■ 4.04
GIPC1-202ENST00000393028 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
GIPC1-202ENST00000393028 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.24■■■■■ 4.03
GIPC1-202ENST00000393028 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.22■■■■■ 4.03
GIPC1-202ENST00000393028 ADGRB1O14514 1584 aa40.21■■■■■ 4.03
GIPC1-202ENST00000393028 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.15■■■■■ 4.02
GIPC1-202ENST00000393028 METP08581 1390 aa40.15■■■■■ 4.02
GIPC1-202ENST00000393028 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.12■■■■■ 4.01
GIPC1-202ENST00000393028 TBX22Q9Y458 520 aa40.11■■■■■ 4.01
GIPC1-202ENST00000393028 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
GIPC1-202ENST00000393028 CARD11Q9BXL7 1154 aa40.07■■■■■ 4
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GIPC1-202ENST00000393028 STK26Q9P289 416 aa40■■■■□ 3.99
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GIPC1-202ENST00000393028 PIK3R4Q99570 1358 aa39.98■■■■□ 3.99
GIPC1-202ENST00000393028 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.98■■■■□ 3.99
GIPC1-202ENST00000393028 NWD1Q149M9 1564 aa39.96■■■■□ 3.99
GIPC1-202ENST00000393028 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.94■■■■□ 3.98
GIPC1-202ENST00000393028 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.94■■■■□ 3.98
GIPC1-202ENST00000393028 USP47Q96K76 1375 aa39.94■■■■□ 3.98
GIPC1-202ENST00000393028 CPS1P31327 1500 aa39.94■■■■□ 3.98
GIPC1-202ENST00000393028 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.9■■■■□ 3.98
GIPC1-202ENST00000393028 TECPR2O15040 1411 aa39.9■■■■□ 3.98
GIPC1-202ENST00000393028 DLC1Q96QB1 1528 aa39.89■■■■□ 3.98
GIPC1-202ENST00000393028 ABCC11Q96J66 1382 aa39.89■■■■□ 3.98
GIPC1-202ENST00000393028 KCNA6P17658 529 aa39.86■■■■□ 3.97
GIPC1-202ENST00000393028 QRICH2Q9H0J4 1663 aa39.85■■■■□ 3.97
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GIPC1-202ENST00000393028 PTCH1Q13635 1447 aa39.83■■■■□ 3.97
GIPC1-202ENST00000393028 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
GIPC1-202ENST00000393028 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.81■■■■□ 3.96
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GIPC1-202ENST00000393028 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
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GIPC1-202ENST00000393028 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
GIPC1-202ENST00000393028 POGKQ9P215 609 aa39.73■■■■□ 3.95
GIPC1-202ENST00000393028 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
GIPC1-202ENST00000393028 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
GIPC1-202ENST00000393028 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.69■■■■□ 3.94
GIPC1-202ENST00000393028 SIRT1Q96EB6 747 aa39.68■■■■□ 3.94
GIPC1-202ENST00000393028 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
GIPC1-202ENST00000393028 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
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