RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFYVE9O95405 1425 aa40.79■■■■■ 4.12
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GNPTAB-202ENST00000392919 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
GNPTAB-202ENST00000392919 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.72■■■■■ 4.11
GNPTAB-202ENST00000392919 HSPA1LP34931 641 aa40.71■■■■■ 4.11
GNPTAB-202ENST00000392919 BCANQ96GW7 911 aa40.71■■■■■ 4.11
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.67■■■■■ 4.1
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNA6P17658 529 aa40.67■■■■■ 4.1
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
GNPTAB-202ENST00000392919 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
GNPTAB-202ENST00000392919 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.63■■■■■ 4.09
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM94Q12767 1356 aa40.6■■■■■ 4.09
GNPTAB-202ENST00000392919 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.59■■■■■ 4.09
GNPTAB-202ENST00000392919 NWD1Q149M9 1564 aa40.58■■■■■ 4.09
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.09
GNPTAB-202ENST00000392919 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM52Q96A61 297 aa40.53■■■■■ 4.08
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.51■■■■■ 4.08
GNPTAB-202ENST00000392919 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.07
GNPTAB-202ENST00000392919 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.07
GNPTAB-202ENST00000392919 ILDR2Q71H61 639 aa40.5■■■■■ 4.07
GNPTAB-202ENST00000392919 TBX22Q9Y458 520 aa40.5■■■■■ 4.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CLTCL1P53675 1640 aa40.48■■■■■ 4.07
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.47■■■■■ 4.07
GNPTAB-202ENST00000392919 TRPM2O94759 1503 aa40.44■■■■■ 4.06
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
GNPTAB-202ENST00000392919 DIP2AQ14689 1571 aa40.39■■■■■ 4.06
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
GNPTAB-202ENST00000392919 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
GNPTAB-202ENST00000392919 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.35■■■■■ 4.05
GNPTAB-202ENST00000392919 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.32■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF1BO60333 1816 aa40.31■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 HRCP23327 699 aa40.31■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 MSH6P52701 1360 aa40.31■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 PIK3R4Q99570 1358 aa40.31■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPRUQ92729 1446 aa40.31■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.31■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.29■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.28■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 FOXD1Q16676 465 aa40.27■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.26■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.26■■■■■ 4.04
GNPTAB-202ENST00000392919 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.19■■■■■ 4.02
GNPTAB-202ENST00000392919 C14orf37Q86TY3 774 aa40.19■■■■■ 4.02
GNPTAB-202ENST00000392919 SLAIN2Q9P270 581 aa40.19■■■■■ 4.02
GNPTAB-202ENST00000392919 METP08581 1390 aa40.19■■■■■ 4.02
GNPTAB-202ENST00000392919 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
GNPTAB-202ENST00000392919 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
GNPTAB-202ENST00000392919 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.1■■■■■ 4.01
GNPTAB-202ENST00000392919 SOCS7O14512 581 aa40.06■■■■■ 4
GNPTAB-202ENST00000392919 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
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GNPTAB-202ENST00000392919 PPLO60437 1756 aa40.04■■■■■ 4
GNPTAB-202ENST00000392919 ATF3P18847 181 aa40.03■■■■■ 4
GNPTAB-202ENST00000392919 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.03■■■■■ 4
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.02■■■■■ 4
GNPTAB-202ENST00000392919 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
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GNPTAB-202ENST00000392919 PHLPP1O60346 1717 aa40■■■■□ 3.99
GNPTAB-202ENST00000392919 RGL3Q3MIN7 710 aa39.95■■■■□ 3.99
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.95■■■■□ 3.99
GNPTAB-202ENST00000392919 DCCP43146 1447 aa39.91■■■■□ 3.98
GNPTAB-202ENST00000392919 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.9■■■■□ 3.98
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.88■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.88■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.87■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.86■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 BRINP3Q76B58 766 aa39.86■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 IFT172Q9UG01 1749 aa39.85■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 MST1RQ04912 1400 aa39.85■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 PTCH1Q13635 1447 aa39.83■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 JCADQ9P266 1359 aa39.83■■■■□ 3.97
GNPTAB-202ENST00000392919 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.79■■■■□ 3.96
GNPTAB-202ENST00000392919 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.77■■■■□ 3.96
GNPTAB-202ENST00000392919 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.77■■■■□ 3.96
GNPTAB-202ENST00000392919 PIK3C2GO75747 1445 aa39.69■■■■□ 3.94
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GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.67■■■■□ 3.94
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
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GNPTAB-202ENST00000392919 LRP6O75581 1613 aa39.65■■■■□ 3.94
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GNPTAB-202ENST00000392919 POTEAQ6S8J7 498 aa39.63■■■■□ 3.93
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.62■■■■□ 3.93
GNPTAB-202ENST00000392919 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
GNPTAB-202ENST00000392919 TECPR2O15040 1411 aa39.59■■■■□ 3.93
GNPTAB-202ENST00000392919 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.59■■■■□ 3.93
GNPTAB-202ENST00000392919 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.58■■■■□ 3.93
GNPTAB-202ENST00000392919 ORAI2Q96SN7 254 aa39.58■■■■□ 3.93
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCC11Q96J66 1382 aa39.56■■■■□ 3.92
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