RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 LTKP29376 864 aa22.64■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.64■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.64■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.63■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.62■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.6■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 BCANQ96GW7 911 aa22.59■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CLTCL1P53675 1640 aa22.58■■□□□ 1.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFYVE9O95405 1425 aa22.57■■□□□ 1.2
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF1BO60333 1816 aa22.56■■□□□ 1.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.55■■□□□ 1.2
PGGT1B-202ENST00000379615 IQGAP1P46940 1657 aa22.55■■□□□ 1.2
PGGT1B-202ENST00000379615 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.55■■□□□ 1.2
PGGT1B-202ENST00000379615 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.53■■□□□ 1.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.51■■□□□ 1.19
PGGT1B-202ENST00000379615 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PIP4K2BP78356 416 aa22.51■■□□□ 1.19
PGGT1B-202ENST00000379615 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.48■■□□□ 1.19
PGGT1B-202ENST00000379615 RGL3Q3MIN7 710 aa22.47■■□□□ 1.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX22Q9Y458 520 aa22.47■■□□□ 1.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.45■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 CPS1P31327 1500 aa22.45■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.42■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPA1LP34931 641 aa22.42■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.42■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNA6P17658 529 aa22.41■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.41■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SOCS7O14512 581 aa22.4■■□□□ 1.18
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3R4Q99570 1358 aa22.38■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.38■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DIP2AQ14689 1571 aa22.38■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 TOM1O60784 492 aa22.37■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 STAC3Q96MF2 364 aa22.37■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ALKQ9UM73 1620 aa22.36■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.35■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 PPLO60437 1756 aa22.34■■□□□ 1.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.32■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.32■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.3■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.29■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.27■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.27■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 MYOM2P54296 1465 aa22.27■■□□□ 1.16
PGGT1B-202ENST00000379615 METP08581 1390 aa22.26■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 IFT172Q9UG01 1749 aa22.26■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 NWD1Q149M9 1564 aa22.25■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 NEUROD1Q13562 356 aa22.24■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.24■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM94Q12767 1356 aa22.24■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3C2GO75747 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.22■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRUQ92729 1446 aa22.21■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.21■■□□□ 1.15
PGGT1B-202ENST00000379615 C14orf37Q86TY3 774 aa22.2■■□□□ 1.14
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.18■■□□□ 1.14
PGGT1B-202ENST00000379615 MSH6P52701 1360 aa22.17■■□□□ 1.14
PGGT1B-202ENST00000379615 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.16■■□□□ 1.14
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.15■■□□□ 1.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PGGT1B-202ENST00000379615 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.14■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 STK26Q9P289 416 aa22.14■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMC1P11047 1609 aa22.13■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.13■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC11Q96J66 1382 aa22.12■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PTCH1Q13635 1447 aa22.12■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.12■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TONSLQ96HA7 1378 aa22.11■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ATF3P18847 181 aa22.1■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.1■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SIRT1Q96EB6 747 aa22.1■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.09■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TECPR2O15040 1411 aa22.07■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 SLAIN2Q9P270 581 aa22.05■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.04■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 DCCP43146 1447 aa22.04■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.03■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.03■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.02■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 POGKQ9P215 609 aa22.02■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.02■■□□□ 1.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRB1O14514 1584 aa22.01■■□□□ 1.11
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