RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377095.9

SLC25A39-202, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-202ENST00000377095 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.22■■■□□ 2.11
SLC25A39-202ENST00000377095 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-202ENST00000377095 IQGAP1P46940 1657 aa28.2■■■□□ 2.1
SLC25A39-202ENST00000377095 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SLC25A39-202ENST00000377095 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
SLC25A39-202ENST00000377095 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC25A39-202ENST00000377095 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
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SLC25A39-202ENST00000377095 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.1■■■□□ 2.09
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SLC25A39-202ENST00000377095 PPLO60437 1756 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC25A39-202ENST00000377095 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A39-202ENST00000377095 RGL3Q3MIN7 710 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A39-202ENST00000377095 IFT172Q9UG01 1749 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SLC25A39-202ENST00000377095 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
SLC25A39-202ENST00000377095 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A39-202ENST00000377095 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC25A39-202ENST00000377095 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC25A39-202ENST00000377095 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC25A39-202ENST00000377095 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SLC25A39-202ENST00000377095 BCANQ96GW7 911 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC25A39-202ENST00000377095 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC25A39-202ENST00000377095 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC25A39-202ENST00000377095 TBX22Q9Y458 520 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC25A39-202ENST00000377095 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC25A39-202ENST00000377095 DIP2AQ14689 1571 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC25A39-202ENST00000377095 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.94■■■□□ 2.06
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SLC25A39-202ENST00000377095 MYOM2P54296 1465 aa27.89■■■□□ 2.06
SLC25A39-202ENST00000377095 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.89■■■□□ 2.05
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SLC25A39-202ENST00000377095 CPS1P31327 1500 aa27.88■■■□□ 2.05
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SLC25A39-202ENST00000377095 NWD1Q149M9 1564 aa27.86■■■□□ 2.05
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SLC25A39-202ENST00000377095 PIK3R4Q99570 1358 aa27.86■■■□□ 2.05
SLC25A39-202ENST00000377095 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.86■■■□□ 2.05
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SLC25A39-202ENST00000377095 NEUROD1Q13562 356 aa27.84■■■□□ 2.05
SLC25A39-202ENST00000377095 PTPRUQ92729 1446 aa27.84■■■□□ 2.05
SLC25A39-202ENST00000377095 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC25A39-202ENST00000377095 STAC3Q96MF2 364 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC25A39-202ENST00000377095 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.81■■■□□ 2.04
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SLC25A39-202ENST00000377095 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.77■■■□□ 2.04
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SLC25A39-202ENST00000377095 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
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SLC25A39-202ENST00000377095 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.72■■■□□ 2.03
SLC25A39-202ENST00000377095 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
SLC25A39-202ENST00000377095 TMEM94Q12767 1356 aa27.7■■■□□ 2.02
SLC25A39-202ENST00000377095 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.69■■■□□ 2.02
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SLC25A39-202ENST00000377095 ADGRB1O14514 1584 aa27.65■■■□□ 2.02
SLC25A39-202ENST00000377095 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
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SLC25A39-202ENST00000377095 TONSLQ96HA7 1378 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC25A39-202ENST00000377095 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC25A39-202ENST00000377095 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.62■■■□□ 2.01
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SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC11Q96J66 1382 aa27.62■■■□□ 2.01
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SLC25A39-202ENST00000377095 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.55■■■□□ 2
SLC25A39-202ENST00000377095 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
SLC25A39-202ENST00000377095 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.53■■■□□ 2
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SLC25A39-202ENST00000377095 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.52■■■□□ 2
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SLC25A39-202ENST00000377095 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.52■■■□□ 2
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SLC25A39-202ENST00000377095 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC25A39-202ENST00000377095 C14orf37Q86TY3 774 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC25A39-202ENST00000377095 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC25A39-202ENST00000377095 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.5■■□□□ 1.99
SLC25A39-202ENST00000377095 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC25A39-202ENST00000377095 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC25A39-202ENST00000377095 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
SLC25A39-202ENST00000377095 DCCP43146 1447 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC25A39-202ENST00000377095 PRAM1Q96QH2 718 aa27.44■■□□□ 1.98
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