RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370291.6

CSAG1-203, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 1,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-203ENST00000370291 ZFYVE9O95405 1425 aa20.52■□□□□ 0.87
CSAG1-203ENST00000370291 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.52■□□□□ 0.87
CSAG1-203ENST00000370291 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.49■□□□□ 0.87
CSAG1-203ENST00000370291 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CSAG1-203ENST00000370291 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSAG1-203ENST00000370291 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CSAG1-203ENST00000370291 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.45■□□□□ 0.86
CSAG1-203ENST00000370291 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.45■□□□□ 0.86
CSAG1-203ENST00000370291 CERKQ8TCT0 537 aa20.44■□□□□ 0.86
CSAG1-203ENST00000370291 BCANQ96GW7 911 aa20.44■□□□□ 0.86
CSAG1-203ENST00000370291 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CSAG1-203ENST00000370291 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.43■□□□□ 0.86
CSAG1-203ENST00000370291 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.41■□□□□ 0.86
CSAG1-203ENST00000370291 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.39■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.39■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.38■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 TBX22Q9Y458 520 aa20.38■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 CPS1P31327 1500 aa20.37■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 RGL3Q3MIN7 710 aa20.37■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 PPLO60437 1756 aa20.36■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.35■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 DIP2AQ14689 1571 aa20.34■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.34■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.34■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 KCNA6P17658 529 aa20.33■□□□□ 0.85
CSAG1-203ENST00000370291 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.33■□□□□ 0.84
CSAG1-203ENST00000370291 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CSAG1-203ENST00000370291 PIK3R4Q99570 1358 aa20.31■□□□□ 0.84
CSAG1-203ENST00000370291 IFT172Q9UG01 1749 aa20.3■□□□□ 0.84
CSAG1-203ENST00000370291 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.3■□□□□ 0.84
CSAG1-203ENST00000370291 FBXO41Q8TF61 875 aa20.29■□□□□ 0.84
CSAG1-203ENST00000370291 NWD1Q149M9 1564 aa20.27■□□□□ 0.84
CSAG1-203ENST00000370291 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.27■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.25■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.24■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 STAC3Q96MF2 364 aa20.23■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 ALKQ9UM73 1620 aa20.23■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.22■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 METP08581 1390 aa20.21■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 MYOM2P54296 1465 aa20.21■□□□□ 0.83
CSAG1-203ENST00000370291 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 PTPRUQ92729 1446 aa20.2■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.19■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 TMEM94Q12767 1356 aa20.19■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 PIK3C2GO75747 1445 aa20.19■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.18■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.18■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 TOM1O60784 492 aa20.17■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.16■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.16■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.16■□□□□ 0.82
CSAG1-203ENST00000370291 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 LAMC1P11047 1609 aa20.13■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 NEUROD1Q13562 356 aa20.12■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.11■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 MSH6P52701 1360 aa20.1■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.1■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.09■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 C14orf37Q86TY3 774 aa20.09■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.08■□□□□ 0.81
CSAG1-203ENST00000370291 PTCH1Q13635 1447 aa20.08■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.07■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 ABCC11Q96J66 1382 aa20.07■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 STK26Q9P289 416 aa20.06■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.06■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.06■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 PIP4K2BP78356 416 aa20.05■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 TECPR2O15040 1411 aa20.04■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 SIRT1Q96EB6 747 aa20.04■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.04■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 ATF3P18847 181 aa20.03■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.02■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.02■□□□□ 0.8
CSAG1-203ENST00000370291 DCCP43146 1447 aa20.01■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.01■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.01■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 ADGRB1O14514 1584 aa20■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 SLAIN2Q9P270 581 aa20■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 TONSLQ96HA7 1378 aa19.99■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.98■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 NALCNQ8IZF0 1738 aa19.98■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.97■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 DLC1Q96QB1 1528 aa19.97■□□□□ 0.79
CSAG1-203ENST00000370291 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.95■□□□□ 0.78
CSAG1-203ENST00000370291 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.93■□□□□ 0.78
CSAG1-203ENST00000370291 PRAM1Q96QH2 718 aa19.93■□□□□ 0.78
CSAG1-203ENST00000370291 POGKQ9P215 609 aa19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms