RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366691.3

RHOU-201, Transcript of ras homolog family member U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOU, Length 4,372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOU-201ENST00000366691 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RHOU-201ENST00000366691 TOPBP1Q92547 1522 aa22.52■■□□□ 1.2
RHOU-201ENST00000366691 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 NCOA1Q15788 1441 aa22.5■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.5■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 ST18O60284 1047 aa22.49■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.49■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.49■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.49■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 IGHDP01880 384 aa22.48■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.48■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 MCCP23508 829 aa22.48■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 C8orf34Q49A92 452 aa22.48■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.47■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.46■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.46■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 UQCRHP07919 91 aa22.46■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 SEC24BO95487 1268 aa22.46■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
RHOU-201ENST00000366691 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.45■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 IFT140Q96RY7 1462 aa22.45■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.44■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 ZNF592Q92610 1267 aa22.44■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.43■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 KANK1Q14678 1352 aa22.43■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.43■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.43■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 FGD1P98174 961 aa22.42■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.42■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.42■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 PDE3AQ14432 1141 aa22.41■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 CUX1P39880 1505 aa22.4■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.4■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 CLCN1P35523 988 aa22.4■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 KIF3BO15066 747 aa22.39■■□□□ 1.18
RHOU-201ENST00000366691 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.38■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 SLFN5Q08AF3 891 aa22.38■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 RILPL2Q969X0 211 aa22.38■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.174e-9■■■■□ 22.6
RHOU-201ENST00000366691 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.38■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 MAP7D2Q96T17 732 aa22.36■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 TOP2BQ02880 1626 aa22.36■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.34■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 RUNDC1Q96C34 613 aa22.34■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 NUCB2P80303 420 aa22.34■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 PTPRKQ15262 1439 aa22.34■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
RHOU-201ENST00000366691 MAP3K1Q13233 1512 aa22.33■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.32■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 PHF14O94880 888 aa22.31■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 CBX1P83916 185 aa22.31■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 MTHFSP49914 203 aa22.31■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 RIPK4P57078 832 aa22.31■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 SSFA2P28290 1259 aa22.3■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 GRIN2BQ13224 1484 aa22.3■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.29■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 PTPRGP23470 1445 aa22.29■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.28■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 CFAP44Q96MT7 982 aa22.28■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.28■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.27■■□□□ 1.16
RHOU-201ENST00000366691 MIA2Q96PC5 1412 aa22.27■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 SYCE3A1L190 88 aa22.26■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 SPC24Q8NBT2 197 aa22.26■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.26■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.26■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 NPHP1O15259 732 aa22.26■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 NRDCO43847 1150 aa22.25■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 TNNQ9UQP3 1299 aa22.24■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 NEK4P51957 841 aa22.24■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 WWC1Q8IX03 1113 aa22.24■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 IFT57Q9NWB7 429 aa22.24■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.23■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 CCDC27Q2M243 656 aa22.22■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 CDC45O75419 566 aa22.21■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.21■■□□□ 1.15
RHOU-201ENST00000366691 FBXW7Q969H0 707 aa22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms